pre-tRNA cappingが担う新規翻訳制御機構の解明

阐明前 tRNA 加帽所发挥的新型翻译控制机制

• 批准号: 21J10419
• 负责人: 菊池 一徳
• 金额: $ 0.9万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-28 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21J10419/
• 关键词: RNA修飾; tRNA; pre-tRNA capping; 翻訳制御; 出芽酵母

令和4年度は、pre-tRNA cappingの生理的機能・生物学的意義の解明のため、以下のような実験を行った。キャップ化されたtRNA前駆体の網羅的解析法、CaSh-seqの改良・解析を実行した。解析の結果、ほぼすべてのtRNAキャップ化効率(Cap score)を算出することに成功した。このCap scoreはtRNA分子の5’末端の構造的自由度と正の相関があること、また熱ストレス下においてこのCap scoreが有意に向上することが示された。また、一般にキャップ化が行われる塩基は転写開始点であると推定できることから、CaSh-seqのデータを詳細に解析することで、ほぼすべての細胞質tRNAの転写開始点を決定することが出来た。また複数の転写開始点（Multi TSS)を持つtRNA遺伝子の存在も示唆され、このうち一部の遺伝子は単離tRNAのLC/MS解析によりMulti TSSが確認できた。キャップ化tRNA前駆体の生物学的な機能としては、翻訳開始因子eIF-4Eとの結合により、mRNAと競合して、キャップ依存的な翻訳を抑制する機能があることがin vitro翻訳実験、in vivoレポーターアッセイの解析から明らかとなった。これらの実験・解析結果から、キャップ化tRNA前駆体は単なる成熟化過程における中間分子に留まらず、熱ストレス下での翻訳制御に関わる機能的な分子である可能性が強く示唆される。

The meaning of physiological and functional biology of Linghe and pre-tRNA capping in 2004 is to understand the meaning of functional biology, and the following information is required. To improve the resolution of the previous tRNA network, and to improve the resolution of the CaSh-seq network. Analyze the results and calculate the success rate (Cap score) of the tRNA data. The degrees of freedom created by the 5 'end of the Cap score tRNA molecule are positively correlated with each other, and the degrees of freedom created by the 5' end of the tRNA molecule are intended to show the degree of freedom. In general, it is necessary to determine the starting point of writing. The starting point of writing determines that the starting point of writing determines that the starting point of writing determines the starting point of writing. The starting point of writing determines that the starting point of writing determines the starting point of writing. The starting point of writing determines that the starting point of writing determines the starting point of writing. It is important to determine the starting point of tRNA. There is an indication that there is an error in the copy number write start point (Multi TSS), and there is a request to leave the tRNA LC/MS parse. the Multi TSS confirms that the data is not valid. To improve the mechanism of tRNA precursor biology, the starting factor of eIF-4E, the combination of eIF-4E, the inhibition of in vitro, and the dependence of gene, the mechanism of inhibition of in vitro, and the analysis of gene analysis, were used to analyze the data. The results of the analysis of the results, the process of maturation of tRNA precursor drugs, the retention of intermediate molecules in the process, and the possibility of molecular flooding in the process of overturning the control mechanism of the system strongly indicate the possibility of instigation.

项目成果

Exploring regulatory translation mediated by pre-tRNA capping in budding yeast

探索芽殖酵母中前 tRNA 加帽介导的调控翻译

• 发表时间: 2022
• 作者: Ittoku Kikuchi;Takayuki Ohira;Taichi Nakatsuka;Yuma Ishigami;Yuichi Shichino;Mari Mito;Shintaro Iwasaki;Tsutomu Suzuki
• 通讯作者: Tsutomu Suzuki