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Studying co-evolution of flowering time diversification and delayed fertilization in Fagaceae

壳斗科开花时间多样化与延迟受精协同进化研究

基本信息

批准号：
21H04781
负责人：
佐竹暁子
金额：
$ 26.71万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-05 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

本研究では、開花時期と受精遅延の協調的進化を駆動する分子メカニズムを、フィールド・ゲノム・数理科学を融合した学際的アプローチによって解明することで、遅延を伴う生殖戦略の進化と種多様性創出プロセスの理解に貢献する。開花時期と受精遅延形質の異なる近縁種間で、発現が異なる遺伝子は何か？に答えるために、マテバシイ属マテバシイとシリブカガシを対象に同一環境に生息し、開花時期と受精遅延期間が異なるブナ科樹木近縁種ペアを対象に、野外トランスクリプトーム解析を実施し、ペア間で異なる発現プロファイルを示す遺伝子を抽出した。同様に、コナラ属コナラ亜属については、福岡市に生息するクヌギとコナラとを、アカガシ亜属についてはアカガシとアラカシを対象とし、サンプル採取を行った。サンプルは各種3個体から葉、芽、花（採取可能な場合のみ）を毎回3反復、1ヶ月に1度採取し、RNA抽出後にサンプルあたり20Mリード以上のRNA sequenceを実施した。またマテバシイとアラカシの新規ゲノムを決定した。本ゲノム情報を用いて、マッピング、リードカウントを行い、遺伝子発現を定量した。

This study では遅と fertilization, flowering period delay の coordinated evolution を駆 dynamic する molecular メカニズムを, フィールド · ゲノム, mathematical science を fusion した learn international アプローチによって interpret することで and 遅 delay をう reproductive 戦 slightly の evolution と kind of many others in making プロセスの understand に contribution する. During the flowering period, と fertilization 遅 heterophyll of the extended form なる interspecific で, が heterophyll なる offspring 伝伝 what? に answer えるために, マテバシイ genus マテバシイとシリブカガシを like に seaborne same environment に interest-bearing し遅と fertilization, flowering period extension が between different なるブナ trees nearly try families ペアを like に seaborne, outdoor トランスクリプトーム parsing を be し, ペアで between different なる発 now プロファイルを shown す heritage 伝 son を spare した. With others in に, コナラ genus コナラ亜 genus については, fukuoka に interest-bearing するクヌギとコナラとを, アカガシ亜 genus についてはアカガシとアラカシを like と seaborne し, サンプル line take をった. サンプルは various 3 individual から leaves, buds, flowers (may take な occasions のみ) を repeatedly in their back to 3, 1 take しにヶ month 1 degrees, after RNA extraction にサンプルあたり 20 m リード more の RNA sequence を be applied した. Youdaoplaceholder0 またテバシテバシとアラカシとアラカシ the new rule ゲノムを decides た. This ゲノム intelligence を with いて, マッピング, リードカウントを line い, but 伝発 now を quantitative した.