Study on active transport phenomena for predicting and controlling biological active matter

预测和控制生物活性物质的主动输运现象研究

基本信息

  • 批准号:
    21H04999
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 122.47万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-07-05 至 2026-03-31
  • 项目状态:
    未结题

项目摘要

本年度は研究の立ち上げを行い、大規模な計算設備と実験設備を入札により導入した。主要な研究実績は以下の通りである。1.テトラヒメナが背景流れに対して走流性を示すことを世界に先駆けて発見した。この成果は総合誌で世界最高峰のScience Advances誌に掲載され、プレスリリースされた(Ohmura, et al., Science Adv. 2021)。 2.クラミドモナスも走流性を示すことを発見した。実験と理論、数値シミュレーションを融合し、そのメカニズムを解明した(Omori, et al., J. Fluid Mech. 2021)。 3.さまざまな遊泳モードを持つ微生物の2体干渉の解析を行い、干渉運動の相図を作成することで、微生物干渉を体系的に理解した(Darveniza, et al., Phys. Rev. Fluids,2022)。 4.数値解析手法の高度化にも取り組み、汎用性の高い境界要素法と近接場が得意な潤滑理論を融合させたLT-BEMを開発した。(Ishikawa, J. Comp. Phys., 2022)。 5.開発した微生物解析プラットフォームをバイオフィルムの形成過程へと展開した。複雑流路内に形成されるストリーマーの形成過程を細胞スケールから調べ、マクロなレオロジー特性とストリーマー形状との関係を解明した(Kitamura, et al., J. R. Soc. Interface, 2021)。 6.開発した微生物解析プラットフォームを酵母の発酵過程へと展開した。マルチスケール解析プラットフォームを用いて培養時の輸送現象を定量的に解明した。この成果はSoft Matter誌の背表紙を飾り、プレスリリースされた(Srivastava, et al., Roy. Soc. Open Sci., 2021; Soft Matter, 2021)。
This year, げを research <s:1> is conducted on ち and げを lines of ち, large-scale な computing equipment と experimental equipment を is introduced into によ た. The main research achievements of な are as follows: な である. 1. テ ト ラ ヒ メ ナ が background flow れ に し seaborne て walk flow sex を shown す こ と を world に 駆 first け て 発 see し た. <s:1> <s:1> results 総 総 are in line with で world 's highest peak <s:1> Science Advances に published され, プレスリリ スされた スされた (Ohmura, et al., Science Adv. 2021). 2 Youdaoplaceholder0 ラ ドモナス ドモナス を drift property を shows す た とを とを occurrence of た た. Be 験 と theory, the numerical シ ミ ュ レ ー シ ョ ン を fusion し, そ の メ カ ニ ズ ム を interpret し た (Omori, et al., j. Fluid Mech at. 2021). 3 Swimming さ ま ざ ま な モ ー ド を hold 2 body dry involved つ microbial の の parsing を い, dry involved exercise combined の 図 を made す る こ と で, dry microorganisms involved を system に understand し た (Darveniza, et al., Phys. Rev. Fluids, 2022). 4 The numerical analytical technique の に empirically も み り group, domestic high の い boundary element method と nearly meet が proud な lubrication theory を fusion さ せ た LT - BEM を open 発 し た. (Ishikawa, J. Comp. Phys., 2022). 5 Development: た microbial analysis: プラットフォ ムをバ ムをバ <s:1> フィ ム ム <s:1> formation process: へと development: た た. Complex 雑 flow within に form さ れ る ス ト リ ー マ ー の formation を cells ス ケ ー ル か ら べ, マ ク ロ な レ オ ロ ジ ー features と ス ト リ ー マ ー shape と の masato is を interpret し た (Kitamura, et al., j. r. Soc. The Interface, 2021). 6 Development: た microbial analysis: プラットフォ ムを ムを yeast fermentation process: へと development: た. Youdaoplaceholder5 チスケ チスケ チスケ て analysis プラットフォ ムを ムを ムを when culturing with て て the <s:1> transport phenomenon を quantitative に explanation of た た. <s:1> <s:1> results プレスリリ Soft Matter を back surface paper を decoration プレスリリ スされた スされた スされた (Srivastava, et al., Roy. Soc. Open Sci., 2021; Soft Matter, 2021).

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Instantaneous puncture for accurate needle insertion in percutaneous intervention
瞬时穿刺,在经皮介入治疗中实现准确进针
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kojiro Sugiyama;Kenji Kikuchi;Tomomi Sato;Sota Oguro;Satoru Yanagaki;Kei Takase;Takuji Ishikawa
  • 通讯作者:
    Takuji Ishikawa
Pairwise scattering and bound states of spherical microorganisms
球形微生物的成对散射和束缚态
  • DOI:
    10.1103/physrevfluids.7.013104
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.7
  • 作者:
    Darveniza C.;Ishikawa T.;Pedley T. J.;Brumley D. R.
  • 通讯作者:
    Brumley D. R.
Microbial Brazil nut effect
微生物巴西坚果效应
  • DOI:
    10.1039/d1sm01327k
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.4
  • 作者:
    Srivastava Atul;Kikuchi Kenji;Ishikawa Takuji
  • 通讯作者:
    Ishikawa Takuji
University of Melbourne(オーストラリア)
墨尔本大学(澳大利亚)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Motion of a Soft Dumbbell Microswimmer in Oscillating Shear Flow and Random Linear Flow
软哑铃微型游泳器在振荡剪切流和随机线性流中的运动
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    A. Doi;T. Omori;T. Ishikawa
  • 通讯作者:
    T. Ishikawa
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  • 通讯作者:
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石川 拓司其他文献

Fluid mechanics of swimming E. coli
游动大肠杆菌的流体力学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Shingo Murata;Yuichi Yamashita;Hiroaki Arie;Tetsuya Ogata;Shigeki Sugano;Jun Tani;石川 拓司
  • 通讯作者:
    石川 拓司
線虫の餌捕食機能における餌粘性の影響
食物粘度对线虫摄食功能的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    鈴木 雄貴;菊地 謙次;沼山 恵子;石川 拓司
  • 通讯作者:
    石川 拓司
バイオイメージングが拓く生物流体工学
由生物成像开创的生物流体学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    菊地 謙次;ノ ヒョンタク; 沼山 恵子;石川 拓司;菊地謙次
  • 通讯作者:
    菊地謙次
Bold goldfish in behavioral neuroscience
行为神经科学中大胆的金鱼
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    加藤 孝信 ;大森 俊宏 ;水野 克俊;石川 拓司;濱田 博司;Yoshida Masayuki
  • 通讯作者:
    Yoshida Masayuki
サカナの行動と心理の比較生物学
鱼类行为和心理的比较生物学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    加藤 孝信 ;大森 俊宏 ;水野 克俊;石川 拓司;濱田 博司;Yoshida Masayuki;吉田将之
  • 通讯作者:
    吉田将之

石川 拓司的其他文献

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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
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バイオメカニクスで紐解くバイオフィルム形成の仕組み
通过生物力学揭示生物膜形成机制
  • 批准号:
    22KF0025
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
バイオメカニクスで紐解くバイオフィルム形成の仕組み
通过生物力学揭示生物膜形成机制
  • 批准号:
    21F30064
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
薬剤輸送を目指した柔らかいマイクロスイマーの開発
开发用于药物运输的软微型游泳器
  • 批准号:
    21KK0064
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
バイオメカニクスで紐解くバイオフィルム形成の仕組み
通过生物力学揭示生物膜形成机制
  • 批准号:
    21F20064
  • 财政年份:
    2021
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Development of a simulator to evaluate the efficacy of an antibacterial agent to resident and resistant bacteria
开发模拟器来评估抗菌剂对常驻细菌和耐药细菌的功效
  • 批准号:
    20K21875
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
バイオメカニクスで紐解くバイオフィルム形成の仕組み
通过生物力学揭示生物膜形成机制
  • 批准号:
    20F20064
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
気道上皮細胞が作る流れの共焦点マイクロPIV計測
共聚焦微型 PIV 测量气道上皮细胞产生的流量
  • 批准号:
    13F02352
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
細胞サスペンジョン力学による医工学研究の新展開
利用细胞悬浮力学进行医学工程研究的新进展
  • 批准号:
    22300149
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
病変を伴う小動脈内の血流と血球同士の干渉による特異流動
有病变的小动脉中的血流和由于血细胞之间的干扰而产生的特定流量
  • 批准号:
    17760137
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
動脈硬化症を伴う細動脈を通る血流と赤血球の特異流動
动脉硬化时小动脉的血流量和红细胞比流量
  • 批准号:
    14750111
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

相似国自然基金

渝产滇重楼复合功能菌的研发与应用
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
酵母可溶性多糖协同益生菌增效机制的研究
  • 批准号:
    JCZRLH202500927
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
基于多组学探讨“清热祛湿”法治疗溃疡性结肠炎的机制
  • 批准号:
    JCZRLH202500133
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
大柴胡汤靶向调节功能菌株治疗肠痈术后肠功能障碍的作用机制研究
  • 批准号:
    JCZRLH202501125
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
肠道微生物通过NLRP3/IL-1β通路介导血管内皮损伤在川崎病及其冠状动脉病变中的作用机制研究
  • 批准号:
    JCZRLH202500452
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
季节性热分层对三峡水库浮游真核微生物生态功能及驱动机制的影响研究
  • 批准号:
    JCZRQN202500522
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
AI驱动的工业微生物合成元件挖掘与产品智造
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
载铁生物炭对土壤镉污染的吸附固定及微生物协同作用机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
基于泛基因组图的微生物宏基因组株水平组成解析方法研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
生殖道微生物调控母猪产后子宫复旧机制解析
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目

相似海外基金

水処理での膜分離技術の広い活用を目指した膜透過性の微生物群集の解明と制御法の開発
阐明膜渗透微生物群落并开发控制方法,旨在在水处理中广泛使用膜分离技术
  • 批准号:
    24K15344
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
生物学的窒素固定微生物群の電気化学的活性促進によるアンモニア生成技術の開発
生物固氮微生物电化学活化制氨技术开发
  • 批准号:
    24K15359
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
共生微生物が駆動するクワガタムシ科甲虫におけるニッチ多様化機構の解明
阐明共生微生物驱动的锹虫生态位多样化机制
  • 批准号:
    24KJ0079
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
外場濃縮された電子供与微生物混合系における電流発生機構の解明
阐明外场富集的供电子微生物混合系统中的电流产生机制
  • 批准号:
    23K21073
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
微生物型ロドプシンをモデル系とした、タンパク質の多様な機能発現の根本原理の解明
使用微生物视紫红质作为模型系统阐明蛋白质多种功能表达背后的基本原理
  • 批准号:
    23K21092
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
赤潮発生に必要な栄養基盤形成機構に海洋環境微生物の物質代謝が果たす役割の解明
阐明海洋环境微生物代谢在赤潮发生所需营养基础形成机制中的作用
  • 批准号:
    23K21236
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
微生物共生系の分子基盤:深海底において糖鎖が織りなす生物間相互作用の体系的解明
微生物共生系统的分子基础:系统阐明深海海底糖链编织的生物体之间的相互作用
  • 批准号:
    23K20307
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ヒ素を還元する発酵細菌:地下水ヒ素汚染の知られざる原因微生物の発見
减少砷的发酵细菌:发现一种导致地下水砷污染的未知微生物
  • 批准号:
    23K26813
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
極小未知細菌群の実態を解明する -活性汚泥から切り拓く微生物新世界-
阐明微小未知菌群的真实——从活性污泥中开辟微生物新世界——
  • 批准号:
    23K27236
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
花の性的二型と昆虫・微生物群集の環境依存的な繋がりを解き明かす
阐明花的两性二态性与昆虫和微生物群落之间的环境依赖性联系
  • 批准号:
    23K27246
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 122.47万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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