放線菌シグナル分子制御系の統合的解明および休眠二次代謝活性化への展開

放线菌信号分子控制系统的综合阐明及其在激活休眠次生代谢中的应用

基本信息

  • 批准号:
    21J14499
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.96万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-28 至 2023-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

放線菌Streptomyes rocheiは35個の二次代謝産物生合成遺伝子クラスターを保有しているが、そのうち大多数の二次代謝産物は未同定である。理由としては、生産収量が低いため検出できていない、培地条件により化合物生産に至っていない、生合成遺伝子の欠損、など様々な理由が想定される。そこで、本研究課題では、制御遺伝子の改変により、転写レベルで生合成遺伝子クラスターを活性化することを試みた。標的遺伝子として、転写抑制を担うシグナル分子レセプターホモログ、活性化を担うSARP型活性化因子に注目し、研究を遂行した。本年度は特に後者の活性因子に注力した。昨年度の研究により、Streptomyces rocheiの染色体上に存在するSARP型活性化因子SRO_3163を過剰発現させることで、親株には見られない新奇代謝産物YM3163-Aの生産が誘導されることを見いだした。SARP型活性化因子SRO_3163遺伝子は二次代謝産物生合成遺伝子クラスターに内包されておらず、グローバルな活性化因子として機能する可能性が示唆された。そこで、コントロール株(空ベクターを保持)と、SRO_3163過剰発現株の転写発現を解析することにより、YM3163-A生合成遺伝子クラスターを特定することを試みた。両菌株のRNAを抽出し、RNA-seq解析を行なった。その結果、複数の生合成遺伝子クラスターにおいて顕著な変化が見られ、単一の生合成遺伝子クラスターに絞り混むことが困難であった。
The 35 <s:1> secondary metabolites of actinomycetes Streptomyes rochei <s:1> biosynthetic residues 伝 offspring <s:1> ラスタ <s:1> を を を を retain <s:1> て るが るが るが and そ うち うち most of the <s:1> secondary metabolites <e:1> are undetermined である. Reason と し て は, low production amount 収 が い た め 検 out で き て い な い, cultivated land conditions に よ り compound production に to っ て い な い, biosynthesis heritage 伝 の owe loss, な ど others 々 な reason が scenarios さ れ る. そ こ で, this research topic で は, royal heritage 伝 son の change - に よ り, planning to write レ ベ ル で biosynthesis heritage 伝 son ク ラ ス タ ー を activeness す る こ と を try み た. Mark heritage 伝 son と し て planning write inhibit を bear う シ グ ナ ル molecular レ セ プ タ ー ホ モ ロ グ activeness を bear う SARP に attention し activation factor, research を carries out し た. This year, <s:1> special に of the latter <s:1> active factor に has been injected with <s:1> た. Yesterday annual の research に よ り, Streptomyces rochei の chromosome に exist す る SARP type activation factor SRO_3163 を before turning 発 now さ せ る こ と で, parent strain に は see ら れ な い YM3163 - A novel metabolites の production が induced さ れ る こ と を see い だ し た. SARP type activation factor SRO_3163 posthumous son 伝 は traces of secondary metabolites biosynthesis 伝 son ク ラ ス タ ー に insourcing さ れ て お ら ず, グ ロ ー バ ル な activation factor と し て function す が る possibility in stopping さ れ た. そ こ で, コ ン ト ロ ー ル strains (empty ベ ク タ ー を keep) と, SRO_3163 turning 発 strains の now planning to write 発 now を parsing す る こ と に よ り biosynthesis, YM3163 - A posthumous son 伝 ク ラ ス タ ー を specific す る こ と を try み た. The <s:1> RNA of the two strains was extracted by を, and RNA-seq was analyzed by を rows of なった. そ の results, plural の biosynthesis heritage 伝 son ク ラ ス タ ー に お い て 顕 the な variations change が see ら れ, 単 の biosynthesis heritage 伝 son ク ラ ス タ ー に ground り mixed む こ と が difficult で あ っ た.

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Understanding of the Streptomyces regulatory network for secondary metabolites production toward development of healthy-ageing society
了解链霉菌次​​生代谢产物产生的调控网络以促进健康老龄化社会的发展
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Misaki Yuya;Arakawa Kenji
  • 通讯作者:
    Arakawa Kenji
Overexpression of SRO_3163, a homolog of Streptomyces antibiotic regulatory protein, induces the production of novel cyclohexene-containing enamide in Streptomyces rochei
SRO_3163(链霉菌抗生素调节蛋白的同源物)的过度表达诱导罗氏链霉菌产生新型含环己烯的烯酰胺
  • DOI:
    10.1093/bbb/zbab206
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Misaki Yuya;Nindita Yosi;Fujita Kota;Fauzi Amirudin Akhmad;Arakawa Kenji
  • 通讯作者:
    Arakawa Kenji
転写活性化因子の強制発現により生産誘導されたエナミド化合物の解析
转录激活剂强制表达产生的烯酰胺化合物的分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Masayuki Kishino;Norihisa Akamatsu;Ryo Taguchi;Shoichi Kubo;Kyohei Hisano;Osamu Tsutsumi;Atsushi Shishido;見崎裕也
  • 通讯作者:
    見崎裕也
SARP 型転写活性化因子 SRO_3163 の過剰発現によるシクロヘキセン含有エナミド化合物の生産
通过过表达SARP型转录激活剂SRO_3163生产含环己烯的烯酰胺化合物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    見崎 裕也;Yosi Nindita; 藤田昂大; Amirdin Akhmad Fauzi; 荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
Activation of secondary metabolites by overexpression of SARP-type activators in Streptomyces
链霉菌中 SARP 型激活剂的过度表达激活次级代谢产物
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S. Osuka;D. Fujimoto;A. Beckers;B. Gierlichs;I. Verbauwhede;Y. Hayashi;見崎裕也
  • 通讯作者:
    見崎裕也
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

見崎 裕也其他文献

Overview of biosynthetic machinery, structural redesign, regulatory network, and genome mining in Actinomycetes
放线菌生物合成机制、结构重新设计、调控网络和基因组挖掘概述
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    見崎 裕也;岩國 美由季;高橋 譲;鈴木 敏弘;木梨 陽康;荒川 賢治;Kenji Arakawa
  • 通讯作者:
    Kenji Arakawa
Streptomyces rochei 7434AN4株の線状ゲノムの全塩基配列決定
罗氏链霉菌 7434AN4 菌株线性基因组的完整核苷酸测序
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yosi Nindita;稲田 晋宣;Amirudin Akhmad Fauzi;手島 愛子;見崎 裕也;Rukman Muslimin;石川 淳;木梨 陽康;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
ミズクラゲの変態制御物質のスクリーニングと単離・構造決定
海月水母变态调控因子的筛选、分离及结构测定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    見崎 裕也;平嶋 友美;藤井 夏鈴;住吉 美保;稲田 晋宣;鈴木 敏弘;星野 有太朗;小山 寛喜;国吉 久人;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
SARP型転写活性化因子の過剰発現による二次代謝生産プロファイルの比較解析
SARP 型转录激活剂过表达导致的次级代谢产物谱的比较分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    劉 洋;見崎 裕也;Yosi Nindita;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
抗生物質生産を制御するシュードレセプターSrrBの機能解析
控制抗生素产生的假受体 SrrB 的功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    見崎 裕也;山本 章治;鈴木 敏弘;岩國 美由季;高橋 譲;稲田 晋宣;木梨 陽康;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治

見崎 裕也的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

相似海外基金

特殊微生物と特殊培養法の融合による新規二次代謝産物の生産
结合特殊微生物和特殊培养方法生产新的次生代谢产物
  • 批准号:
    24K09865
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
針葉樹二次代謝産物の腐朽菌による生物変換機構の網羅的解析
腐烂真菌对针叶次生代谢产物生物转化机制的综合分析
  • 批准号:
    23K21222
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
アンフィジニウム属渦鞭毛藻の有用二次代謝産物の探索と開発
蛇鞭藻属有用的次生代谢产物的搜索和开发
  • 批准号:
    23K21364
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
樹幹損傷時に生成される樹脂中の非揮発性二次代謝産物の生成機構と機能解明
阐明树干受损过程中产生的树脂中非挥发性次生代谢产物的产生机制和功能
  • 批准号:
    24KJ0173
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
放線菌の持つ特異な窒素含有構造を持つ二次代謝産物生合成機構の解析
放线菌独特含氮结构次生代谢产物生物合成机制分析
  • 批准号:
    23K23459
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Understanding regulation of biosynthetic gene clusters to facilitate production of secondary metabolites
了解生物合成基因簇的调控以促进次级代谢产物的产生
  • 批准号:
    2898868
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Studentship
植物の有用二次代謝産物生産を活性化する分子技術の開発と展開
开发和部署分子技术以激活植物中有用的次生代谢物的产生
  • 批准号:
    22KJ0241
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Development of molecular technologies to enhance production of useful secondary metabolites in plants
开发分子技术以提高植物中有用的次生代谢产物的产量
  • 批准号:
    23K17967
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
イネにおける防御関連二次代謝産物の多様化
水稻防御相关次生代谢物的多样化
  • 批准号:
    22KJ2298
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Doctoral Dissertation Research: The influence of plant secondary metabolites on diet selection, nutrition, and health in wild primates
博士论文研究:植物次生代谢产物对野生灵长类动物饮食选择、营养和健康的影响
  • 批准号:
    2141917
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 0.96万
  • 项目类别:
    Standard Grant
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了