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DNA解析と無機成分分析による植物標本の生育地及び集団を解明する手法の開発

开发利用 DNA 分析和无机成分分析阐明植物标本栖息地和种群的方法

基本信息

批准号：
21K01008
负责人：
吉川ひとみ
金额：
$ 2.58万
依托单位：
National Research Institute of Police Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

研究2年目の本年は、1年目で開発した配列解析手法を用いて、異なる地域由来のコセンダングサをゲノム横断的塩基多型解析手法であるMIG-seq法により識別できるか否か、詳細な検討を行った。千葉県、埼玉県および神奈川県の3地点で、1地点につき9-10試料採取したコセンダングサを試料とした。採取した植物体のうち、1地点につき1試料から痩果7-10個を採取し、これもあわせて解析に用いた。得られた配列について昨年度開発した手法、すなわち、DNAの解析を2回の行った後試料毎に1対1で比較し、2回ともに異なる塩基であった箇所の個数を求めることにより、識別を行った。まず、痩果同士を比較した。その結果、同じ地点由来の痩果を比較した場合には、69 ％で異なる塩基が認められず、平均で0.5の塩基しか異なっていなかった。それに対し、異なる地点から採取したものでは、平均して19.9の異なる塩基が認められた。次に痩果と植物体を比較した。その結果、痩果とそれを採取した元の植物体とでは46％で異なる塩基が認められず、平均で1.1の塩基が違っていた。それに対し、異なる地点から採取した植物体と痩果を比較した場合には、異なる塩基が平均して20.1認められた。これらの結果から、対照試料として痩果、元の植物体どちらを用いた場合にも、異なる地域由来の試料は異なると識別できる可能性が示された。さらに、痩果が得られた地点の別の植物体と比較したところ、明らかに異なると判断できるものも存在し、同一地点の中でも、どの植物体と同じか判断できる場合があると考えられた。無機成分分析については、実験担当者が1年間異なる業務を兼務したため多忙となり、実際に解析を行うことが困難であったことから、本年は予備検討の準備を行うにとどまった。

This paper studies the method of multi-type analysis for the first and second years of this year's development, and discusses the method of multi-type analysis for the second year's development. Chiba, Saitama, Kanagawa, 3 places, 1 place, 9-10 samples, take samples, Take the plant body, 1 place, 1 sample, 7-10 fruits, take it, 2 places, analyze it The number of samples in each of the 2 rounds of DNA analysis was calculated by comparing the number of samples in each of the 2 rounds of DNA analysis with the number of samples in each of the 2 rounds of DNA analysis. Compare with the same person. The results were similar to those of the same location, and 69% of the results were different from those of the same location, with an average of 0.5. On average, the difference between the two is 19.9%. The second fruit is compared with the plant body. The results, fruits and vegetables were taken from the plant body and 46% of the plant body was taken from the plant body. The average number of plant bodies was 1.1. The plant and fruit are compared in different places, and the average is 20.1%. The results show that the probability of identification of samples from different regions is higher than that of samples from different regions. The plant body of the same place is different from that of the same place. Inorganic component analysis is difficult for those who are responsible for different business activities in one year, and preparation for this year's review is difficult.