Practical construction of next-generation specimen image digitization method for academic data distribution

学术数据分发下一代标本图像数字化方法的实用构建

• 批准号: 21K01012
• 负责人: 大西 亘
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kanagawa Prefectural Museum of Natural History
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K01012/
• 关键词: 学術データ流通; 標本デジタル化; オープンサイエンス; クロスリファレンス; FAIR原則

2022年度は、本研究で計画する次世代型の標本デジタル化システムを構築するため、引き続き既存手法に関する情報収集や課題の整理を実施するとともに、撮影システムの主要な部分を構築し、実際に標本デジタル化を実施して経験的な情報の蓄積と課題の整理を行った。具体的な実施内容としては、研究計画時の予定に沿って、標本デジタル化手法の開発と標本デジタル化の実施を主として実施し、あわせて学術データ流通を考慮した標本画像データ発信手法の開発と整備にも取り組んだ。標本デジタル化手法の開発については、撮影手法ごとに適切なシステムを構築する必要があるものの、予算と実施期間に限りがあるため、2022年度には、対象資料と撮影手法を限定して、撮影システムを構築した。標本デジタル化の実施については、構築した撮影システムによるデジタル化を試行的に実施し、作業者からのフィードバックにより適宜システムの修正を加えながら運用上の課題の洗い出しや作業工程の汎用手順書の作成など、標準化のための情報蓄積を実施した。学術データ流通を考慮した標本画像データ発信手法の開発と整備については、国内の植物標本室関係者への聞き取りや情報収集を継続的に実施し、標本の収蔵状況や標本のデジタル化と学術データ流通の実施状況の把握に努めた。なお、本研究の申請時には海外植物標本室を直接訪問して、先進的な取り組み事例の調査を計画していたが、新型コロナウイルス感染症の感染拡大状況に加え、極端な円安の継続によって、渡航費用ならびに滞在費用の高騰によって当初計画した予算内での実施が難しい見通しであったため、直接の訪問は行わず、オンラインでのやり取りを通じた情報収集や、国内他資料分野の研究者との交流を通じた情報収集に努めた。

2022 は, plan this study で す る nextgen type specimens of の デ ジ タ ル change シ ス テ ム を build す る た め and き 続 き existing technique に masato す る intelligence 収 set や subject の finishing を be applied す る と と も に, pinch of shadow シ ス テ ム の built primarily な part を し specimens of the event, be に デ ジ タ ル change を be applied し て 経 験 な intelligence の の finishing を accumulation と subject Line った. Specific な be applied content と し て は, research projects の designated に along っ て, specimen デ ジ タ ル gimmick の turn 発 と specimen デ ジ タ ル change の be applied を main と し て be し, あ わ せ て academic デ ー タ circulation を consider し た specimen portrait デ ー タ 発 letter technique の open 発 と servicing に も group take り ん だ. Specimen デ ジ タ ル gimmick の turn 発 に つ い て は, pinch of shadow technique ご と に appropriate な シ ス テ ム を build す る necessary が あ る も の の, to calculate と be applied during に limit り が あ る た め, 2022 annual に は, like data と pinch of seaborne shadow technique を qualified し て, pinch of shadow シ ス テ ム を build し た. Specimen デ ジ タ ル change の be applied に つ い て は, constructing し た pinch of shadow シ ス テ ム に よ る デ ジ タ ル を trial of に be し, operators か ら の フ ィ ー ド バ ッ ク に よ り suitable シ ス テ ム の correction を plus え な が ら use の subject の い washing out し や homework projects の domestic hand along the book の done な ど, standardized の た め の intelligence accumulation を be applied し た. Academic デ ー タ circulation を consider し た specimen portrait デ ー タ 発 letter technique の open 発 と servicing に つ い て は, masato is the domestic の plant specimen へ の smell き take り や intelligence 収 set を 継 続 of に be し, specimen の 収 蔵 condition や specimen の デ ジ タ ル change と academic デ ー タ circulation の be applied condition の grasp に Mr め た. な お, when applying for this study の に は overseas herbaria を direct access し て group, advanced な take り み examples の survey を program し て い た が, new コ ロ ナ ウ イ ル ス adapting just-in-time inventory company, big situation に plus え の infection, extreme な has drifted back towards ¥ の Ann 継 続 に よ っ て, tayouan な ら び に lag in cost の golden に よ っ て original plan し た to calculate within で の be が し difficult い see tong し で あ っ た た め, direct の access line は わ ず, オ ン ラ イ ン で の や り take り を tong じ た や, domestic intelligence 収 set his data eset researchers の と の communication を tong じ た intelligence 収 set に Mr め た.

项目成果

センジョウスゲ（カヤツリグサ科）の生育状況

莎草（莎草科）生长状况

• 发表时间: 2022
• 期刊: 莎草研究
• 作者: 矢野興一;大西 亘
• 通讯作者: 大西 亘

Evaluation of Papers Suitable for Mounting Herbarium Specimens

适合安装植物标本室标本的纸张的评估

• DOI: 10.51033/jjapbot.97_6_11212
• 发表时间: 2022
• 期刊: The Journal of Japanese Botany
• 作者: 田中伸幸;大西 亘;島田 要;野田 弘之;沓名 貴彦
• 通讯作者: 沓名 貴彦