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Mechanistic Insights into metal- and enzyme-catalyzed reactions using hybrid quantum chemical and information science approaches

Mechanistic Insights into metal- and enzyme-catalyzed reactions using hybrid quantum chemical and information science approaches
使用混合量子化学和信息科学方法对金属和酶催化反应的机理洞察
批准号:
21K05016
负责人:
森 聖治
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究では、高精度量子化学計算と情報科学的解析を融合させることで、金属を用いた均一的触媒反応および酵素反応機構の非共有結合性相互作用、添加物の効果、立体配座によるエネルギー分布をはじめとした統計力学的効果および動力学効果の役割を明確にすることを目的とする。2022年度の実績として、Rh触媒によるN-8-Aminoquinolinyl Aromatic AmidesのC-H結合活性化に始まるα―マレイミドとのカップリング反応で、アルキル化が進行したことを踏まえたDFT計算を行い、芳香族アミド・オルトC-H結合の酸化的付加が、turnoverを決定する段階であることを示した。この反応で添加物の効果などを明らかにした。イリジウム(III)ーサレン錯体を触媒とするジアゾ化合物とエチルベンゼンおよびその誘導体との反応で、99%eeの高い選択性でカップリング生成物が得られることに対し、カルベンが結合したイリジウム(III)ーサレン錯体の構造における立体配座をDFT計算で予測したほか、C-H結合のカルベン挿入反応が、協奏的に起きることをモデル系で明らかにした。さらに、フェレドキシン依存酵素PcyAの基質ビリベルジン(BV)に近い位置にあって反応に関与するアスパラギン酸105番残基をアスパラギンに置換した変異体、あるいはイソロイシン86番残基をアスパラギン酸に置換した変異体の中性子構造解析および、可視紫外吸収スペクトルの変異体における変化について、QM/MM計算によって検討し、また基質BVのプロトン化状態との関係について報告した。銅(I)―フェノキシルラジカル錯体の可視紫外吸収スペクトルを測定し、TD-DFT計算で解釈を行い報告した。
期刊论文(35)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Yamamoto Koji, Imai Wakana, Kanamori Satoki, Yamamoto Koji, Nakamura Yosuke, 森 聖治]
通讯作者: 森 聖治
物理有機化学ホームページ
物理有机化学主页
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
DOI: 10.1039/d3qo00023k
发表时间: 2023-02-13
期刊: ORGANIC CHEMISTRY FRONTIERS
影响因子: 5.4
作者: [Skhiri,Aymen, Taborosi,Attila, Chatani,Naoto]
通讯作者: Chatani,Naoto
Non-innocent redox behavior of CuII-pi-dimethylaminophenolate complexes: formation and characterization of the CuI-phenoxyl radical species
CuII-pi-二甲基氨基苯酚络合物的非无害氧化还原行为:CuI-苯氧基自由基物种的形成和表征
DOI: 10.1039/d2cc01409b
发表时间: 2022
期刊: Chemical Communications
影响因子: 4.9
作者: [Shima Yuto, Suzuki Takashi, Abe Hitoshi, Yajima Tatsuo, Mori Seiji, Shimazaki Yuichi]
通讯作者: Shimazaki Yuichi
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    生理活性物質の生合成反応における酵素の役割
    • 批准号:
      20038005
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.98万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      森 聖治
    • 依托单位:
    有機化学反応における電子状態および溶媒の制御に関する理論的研究
    • 批准号:
      14740338
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      森 聖治
    • 依托单位:
    有機金属会合体の反応理論構築と反応設計