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Establishment of method for detecting viral protease activity using affinity competition

亲和竞争检测病毒蛋白酶活性方法的建立

基本信息

批准号：
21K05301
负责人：
日高興士
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究課題では、感染細胞に由来する新型コロナウイルスの2種のプロテアーゼを標的にリムーバブル阻害剤を各種合成し、モデル検体から親和性競合による酵素活性の検出を行い、感染細胞の有無の判定につながる画期的な検査薬の開発に向けて新型コロナウイルスの正確で簡便な新規検出法の確立をめざす。R3年度にMproおよびPLproに関して大腸菌での発現を試みた結果、SDS-PAGE分析により、ともに大腸菌抽出液の可溶性画分に発現タンパク質と思われるバンドが検出された。特に、PLproに関しては最も主要なバンドとして検出され、大量発現に成功したことが示された。そこで、R4年度の取り組みにおいては、Mproの可溶性画分での発現量の増大を目的とした。分子設計に関しては、すでに報告されているMproの立体構造を参考にして、分子表面の一部のアミノ酸を改変することとした。今回は、アミノ酸側鎖が分子表面に存在する疎水性アミノ酸のうちから、比較的溶媒への露出が高く、酵素の触媒部位に影響を与えないと考えられる部位を選択した。変異体としては、I59R、F223E、F223E/L232Rの3種を作製することとし、変異体の発現プラスミドを作製したのちに、大腸菌発現を試みた。しかしながら、SDS-PAGEにて分析したところ、発現量の顕著な増大は認められなかった。今後は、Mproに関しては収量が少ないことが見込まれるが継続して野生型を用いることとする。そして、既存のMproおよびPLpro阻害剤のビオチン化合成を再検討し、本リコンビナントMproやPLproを用いて共結晶構造の解析や生体資料からの酵素活性の検出を進める。

This study aims to investigate the origin of two types of novel virus infection, synthesis of various inhibitors, identification of enzyme activity, identification of the presence or absence of infected cells, and establishment of a new, simple and accurate method for detecting novel virus infection. In R3, Mpro and PLpro were tested for the development of E. coli, and SDS-PAGE analysis was performed to determine the soluble fraction of E. coli extract. In particular, PLpro is the most important factor in the success of the project. The amount of soluble Mpro in the R4 group increased. Molecular design is related to Mpro's three-dimensional structure, and part of the molecular surface is modified. In this paper, the presence of acid on the surface of the molecule, the presence of water, the presence of acid on the surface of the molecule, the presence of solvent, the presence of catalyst sites, the presence of catalyst sites, and the presence of catalyst sites are selected. The three species, i.e., I59R, F223E, and L232R, were tested for their ability to control the development of different species and coliform bacteria. SDS-PAGE analysis and detection In the future, the amount of Mpro involved will be less than that of wild type. In addition, the analysis of co-crystal structure and biological data of existing Mpro and PLpro inhibitors and the detection of enzyme activity are also discussed.