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コムギのNucleolar Dominanceからみた異種ゲノム調和機構の解析

从核仁优势角度分析小麦异质基因组协调机制

基本信息

批准号：
21K05518
负责人：
半田裕一
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Kyoto Prefectural University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度までに、コムギの1A, 1B, 5D, 6B及び7D染色体に存在するNORそれぞれに特異的なrDNA unitサブタイプを見出すことを目的に、コムギ参照ゲノム配列RefSeqを利用して、各NOR配列から２つの新規サブタイプを含め合計６つのサブタイプを同定した。今年度は、各サブタイプについて、q-PCRを用いて品種Chinese Spring (CS)のゲノム中の存在量比を確認した。その結果、Subtype 1はこれまでに1Bと6B染色体の主要NORの構成要素であるとされてきたが、それに加えて1A染色体にも存在している可能性が示された。Subtype 2は1Bと6B染色体で確認され、Subtype 1と同様にBゲノム特異的であると推定された。Subtype 3及び4は、それぞれ5Dおよび6Bの単一染色体特異的であることが明らかとなった。新規サブタイプであるSubtype 5は1A染色体特異的、そしてSubtype 6は5Dと7D染色体に分布しており、Dゲノム特異的であることを明らかとした。さらに、CSと1B及び6B座乗のNORを欠失したDitelo1BL及びDitelo6BL系統を用いて各サブタイプの発現状況をqRT-PCRで確認し、Nucleolar Dominanceとの関連を調査した。CSではSubtype 1のみが発現しており、他のサブタイプは発現していなかった。Ditelo1BL及びDitelo6BLでは、Subtype 1の発現に加えてSubtype 6の発現が確認できた。これは主要NORの欠失によりDゲノム染色体のNORへのドミナンスが解除され、抑制されていたSubtype 6の発現が回復したと考えられる。回復程度にはDitelo1BLとDitelo6BLで差があり、1Bと6BのNORによるドミナンスの強さには特異性があることが示された。

In the past year, the presence of NOR on chromosomes 1A, 1B, 5D, 6B, and 7D was determined by the presence of specific rDNA unit sites. This year, the number of species present in each species of Chinese Spring (CS) was confirmed by q-PCR As a result, Subtype 1 was found to be a major NOR component of chromosome 1B and 6B. Subtype 2: chromosome 1B: chromosome 6: chromosome 1B: chromosome 6: chromosome 1B: chromosome 1B: chromosome 1B: Subtype 3 and Subtype 4 are 5D and 6B chromosomes. The new rule is that Subtype 5 is specific for chromosome 1A, Subtype 6 is specific for chromosome 5D and 7D, and Subtype 6 is specific for chromosome 5D and 7D. The status of each node was confirmed by qRT-PCR and the relationship between the two nodes was investigated. CS Subtype 1 Ditelo1BL and Ditelo6BL are confirmed by the discovery of Subtype 1. The main NOR loss is caused by the elimination, suppression, and recovery of the chromosome's NOR loss. The degree of recovery is different from Ditelo1BL to Ditelo 6BL. The difference between Ditelo1BL and Ditelo 6BL is different from that between Ditelo 1BL and Ditelo 6BL.