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Identification of genes responsible for agronomic traits under reproductive stage in spinach, by using a high quality genome sequence.

通过使用高质量的基因组序列鉴定负责菠菜繁殖阶段农艺性状的基因。

基本信息

批准号：
21K05525
负责人：
小野寺康之
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Hokkaido University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05525/
关键词：
抽苔性性発現ホウレンソウ生殖

项目摘要

3つの抽苔性QTL領域から見出された候補遺伝子として同定されたシロイヌナズナFTおよびCOホモログの解析を試みた．2つのQTL qBt3.1およびqBt3.2領域には，それぞれ3および1コピーのFTホモログが座乗しており，昨年の解析では，花芽分化時期にqBt3.1に座乗するFTホモログは日周変動を伴う発現が見出されたが，qBt3.2領域に座乗するホモログは発現がほとんど見出されなかった．R4年度は，これらのFTホモログの強制発現シロイヌナズナを作出し，機能解析を試みた．その結果，少なくともqBt3.1領域に座乗するFTホモログは花成促進機能を有する可能性が確認され，当該QTLの責任遺伝子ある可能性性が示唆された．qBt3.2領域に座乗するホモログの強制発現シロイヌナズナも4株作出し，いずれも花成タイミングが早くなることが示唆された．ただし，調査個体数が少ないので，R5年度に継続して解析する予定である．qBt2.1領域から見出されたCOホモログの発現解析を行った結果，日周変動を伴って発現することが判明した．また，ホウレンソウには，その他にCOホモログが3コピー存在するため，これらの発現解析も併せて行った．その結果，これらのCOホモログはいずれも日周変動を伴う発現が見出された．しかしながら，COホモログのコピー間で日周変動パターンが互いにことなうことが判明した．ホウレンソウにおいて，CO-FT制御カスケードが保存されている可能性を検証するために，早抽系統x晩抽系統F4およびF5世代から，qBt2.1座（CO）が分離し，qBt3.1およびqBt3.2座（FT）が固定された集団を育成した．R5年度はこれらの個体を，FTおよびCOホモログの発現解析に活用する計画である．

3. QTL field for mossy growth was found to be candidate genes for identification and analysis of FT and CO genes. 2. QTL qBt3.1 and qBt3.2 field was found to be candidate genes for identification and analysis of FT genes for identification and analysis of QTL qBt3.1 and qBt3.2 field was found to be candidate genes for identification and analysis of QTL qBt3.1 and qBt3.2 field was found to be candidate genes for identification and analysis of QTL qBt3.1 and qBt3.2 field was found to be candidate genes for identification and analysis of QTL qBt3.1 and qBt3.2 field was found to be candidate genes for identification and analysis of QTL qBt3.1 and qBt3.1. qBt3.2 Field test results show that there is a problem with the occurrence of stress. R4 annual test results show that there is a problem with the occurrence of stress. Function analysis test results. As a result, the likelihood of a QTL promoting flower growth was confirmed when the likelihood of a gene responsible for the QTL was shown. qBt3.2 The likelihood of a QTL promoting flower growth was shown when the gene responsible for the QTL was shown. The number of individuals surveyed is small, and the analysis of the expected results in the field of R5 is small. The analysis of the occurrence of CO in the field of R5 is small. The analysis of the occurrence of CO in the field of R5 is small. It's a good idea. It's a good idea. It's a good idea. As a result of this, the CO in the middle of the day is moving. The sun is shining brightly in the sky, and the sun is shining brightly in the sky. The CO-FT control system has the possibility to be preserved. The early pumping system x the late pumping system F4 and F5 generations have been separated. The qBt2.1 block (CO) has been separated. The qBt3.1 block (FT) has been fixed. The R5 year has been separated from the individual. The FT and CO generation analysis plan has been used.