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Characterization of the causative gene of Csc1, an self-compatible locus of Chrysanthemum seticuspe

菊花自交亲和基因座 Csc1 致病基因的表征

基本信息

批准号：
21K05564
负责人：
中野道治
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kochi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

キクタニギクに見出された自家和合性遺伝子座Csc1の原因遺伝子同定を目指して研究を進めた。昨年度明らかにされたトランスポゾン挿入が起こった変異に関して形質転換体の作出を進めたが、過剰発現コンストラクト、ノックアウトコンストラクト共に形質転換体を作出できておらず進捗が滞っている。使用する培地の植物ホルモン組成、選抜に使用する抗生物質の種類を再検討しており、研究期間中での形質転換体の評価を目指す。Csc1遺伝子座がS遺伝子座であるかModifier遺伝子座であるかについて、交配実験により調べた。キクタニギク野生系統（不和合性）×Gojo-1（和合性）のF1系統について、Gojo-1に対する正逆交雑及びF1系統の自殖を行って種子結実を調べたところ、Gojo-1に対する交雑では種子形成が認められたのに対してF1系統の自殖では種子形成は認められなかった。この結果よりCsc1変異はModifierではなくS遺伝子座によるものと考えられた。近年、キク属のゲノム解析が盛んとなっており、Gojo-0以外にも近縁種3種で染色体レベルのゲノム配列が公開され、Gojo-0をリファレンスとする場合には不可能な不和合性ゲノム配列をリファレンスとする解析が可能となった。そのため、これらのゲノム配列を用いてキクタニギク野生系統及びGojo-0のリシークエンスデータをマッピングし変異のアノテーションを進めている。これまでの解析の中で、当該領域にはSLPK遺伝子がタンデムに3～4コピー存在しており、そのコピー数は系統によって異なる可能性があることが明らかとなった。これらに加えて構造変異の有無、予測遺伝子の有無などのゲノム間のハプロタイプ比較を進めている。

The study of genetic identity of Csc1 and Csc1 is progressing. In the past year, we have made progress in the production of physical transformation products, and we have made progress in the production of physical transformation products. A review of the composition of plant species used in culture, the types of antibiotics selected for use, and the evaluation of morphological changes during the study period Csc1 F1 system for wild system (incompatibility) ×Gojo-1 (compatibility), Gojo-1 system for positive and negative interaction, and F1 system for autogenesis. Seed node for regulation, Gojo-1 system for negative interaction, seed formation, and autogenesis. The result is that Csc1 is different from Modifier 2. In recent years, it is impossible to analyze the chromosome alignment of three species other than Gojo-0, which are close to each other, and in the case of Gojo-0, which is open to the public. In addition to the above, it is also necessary to improve the quality of the products. In this case, the probability of SLPK gene mutation is 3~4 degrees, and the probability of SLPK gene mutation is 4 degrees. The structure of the structure is different, the prediction is different, and the comparison between the structure and the prediction is different.