Characterization of the causative gene of Csc1, an self-compatible locus of Chrysanthemum seticuspe

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キクタニギクに見出された自家和合性遺伝子座Csc1の原因遺伝子同定を目指して研究を進めた。昨年度明らかにされたトランスポゾン挿入が起こった変異に関して形質転換体の作出を進めたが、過剰発現コンストラクト、ノックアウトコンストラクト共に形質転換体を作出できておらず進捗が滞っている。使用する培地の植物ホルモン組成、選抜に使用する抗生物質の種類を再検討しており、研究期間中での形質転換体の評価を目指す。Csc1遺伝子座がS遺伝子座であるかModifier遺伝子座であるかについて、交配実験により調べた。キクタニギク野生系統（不和合性）×Gojo-1（和合性）のF1系統について、Gojo-1に対する正逆交雑及びF1系統の自殖を行って種子結実を調べたところ、Gojo-1に対する交雑では種子形成が認められたのに対してF1系統の自殖では種子形成は認められなかった。この結果よりCsc1変異はModifierではなくS遺伝子座によるものと考えられた。近年、キク属のゲノム解析が盛んとなっており、Gojo-0以外にも近縁種3種で染色体レベルのゲノム配列が公開され、Gojo-0をリファレンスとする場合には不可能な不和合性ゲノム配列をリファレンスとする解析が可能となった。そのため、これらのゲノム配列を用いてキクタニギク野生系統及びGojo-0のリシークエンスデータをマッピングし変異のアノテーションを進めている。これまでの解析の中で、当該領域にはSLPK遺伝子がタンデムに3～4コピー存在しており、そのコピー数は系統によって異なる可能性があることが明らかとなった。これらに加えて構造変異の有無、予測遺伝子の有無などのゲノム間のハプロタイプ比較を進めている。