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Elucidation of the egg diapause mechanism of the Teleogryllus emma based on comparative transcriptome analysis

基于比较转录组分析阐明Teleogryllus emma卵滞育机制

基本信息

批准号：
21K05614
负责人：
竹田真木生
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

成育に不適な季節をやり過ごし、かつ効率的な生殖のために発育ステージを揃える生活史戦略として、休眠性を有する昆虫は多い。日本全域に生息するエンマコオロギは、年一化で内因性の卵休眠を示す。一方、その近縁種であるタイワンエンマコオロギは、主に九州や南西諸島に生息し、年二化かつ非休眠性である。また、母性効果による卵休眠の運命決定を特徴とするマダラスズにも着目した。そこで本研究では、休眠性・非休眠性のコオロギの全ゲノム塩基配列情報に基づいた比較トランスクリプトーム解析により、コオロギ科の卵休眠機構を解明することを目的としている。当該年度は、エンマコオロギ・タイワンエンマコオロギの全ゲノム塩基配列の精緻化と、卵休眠の母性効果を示すマダラスズの全ゲノム塩基配列解読、マダラスズの休眠卵と非休眠卵の比較トランスクリプトーム解析を実施した。エンマコオロギ属2種については、Pacific Bioscience社およびOxford NanoporeTechnologies(ONT)のロングリードシークエンスデータ、IlluminaのショートリードシークエンスデータおよびDovetail GenomicsのOmni-Cデータを用いて、高品質なドラフトゲノムを構築した。マダラスズについては、ONTのロングリードシークエンスデータ、IlluminaのショートリードシークエンスデータおよびDovetail GenomicsのOmni-Cデータを用いたHiRise解析によって、染色体レベルのドラフトゲノムを構築した。タイワンエンマコオロギ（非休眠卵）およびマダラスズ（母性効果による卵休眠）については、染色体レベルのドラフトゲノムに基づく、遺伝子アノテーションが完了した。また、マダラスズの卵休眠の比較トランスクリプトーム解析によって、休眠運命を決定づけるタイミング等が明らかになった。

Insects that are not suitable for reproduction, reproduction, and dormancy Japan's entire region of life, a year of intrinsic egg dormancy One side, two close to the species, the main Kyushu Ryukyu Islands live, the year two The characteristics of egg dormancy The purpose of this study is to clarify the mechanism of egg dormancy by comparing and analyzing the basic information of dormancy and non-dormancy. When the year is over, the total number of eggs in the egg is refined, and the total number of eggs in the egg dormancy is displayed. The comparative analysis of dormant eggs and non-dormant eggs is performed. The two species are Pacific Bioscience and Oxford Nanopore Technologies (ONT), Illumina and Dovetail Genomics. HiRise analysis of Omni-C data from Dovetail Genomics, HiRise analysis of dye, HiRise analysis of dye. In addition, it is necessary to carry out the following measures: (1) to carry out the work of the Ministry of Health;(2) to carry out the work of the Ministry of Health;(3) to carry out the work of the Ministry of Health; and (4) to carry out the work of the Ministry of Health. A comparison of egg dormancy, dormancy fate determination, etc.