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シングルセルRNA-seqを用いた抗HIV抗体投与による寛解メカニズムの解析

使用单细胞 RNA-seq 分析抗 HIV 抗体给药诱导的缓解机制

基本信息

批准号：
21K05989
负责人：
桑田岳夫
金额：
$ 2.58万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05989/
关键词：
抗体 SHIV カニクイザル RNA-seq シングルセル

项目摘要

本研究の目的は、抗HIV-1抗体の投与によってHIV-1感染が寛解状態に至るメカニズムの解明である。 SHIV感染カニクイザル・モデルにおいて、抗HIV抗体の3回投与によってウイルス増殖を持続的に抑制したサルと、抑制しなかったサルが認められた。昨年度は、抗体投与後に採取したリンパ節のsingle cell RNA sequencingを行い、カニクイザルでの細胞群特定のマーカー遺伝子の同定を行った。今年度は、新たに感染後4週のリンパ節を4頭のサルから採取して解析に加えた。また、新たなマーカー遺伝子を同定し、T細胞、B細胞、centroblast、centrocyte、plasmablast、NK細胞、単球、myeloid DC、plasmacytoid DC、innate lymphoid cellに細胞群を分類した。T細胞は、さらにnaive CD4+ T細胞、central memory CD4+ T細胞、T effector memory CD4+細胞、follicular helper CD4+ T細胞、regulatory T細胞、naive CD8+ T細胞、effector memory CD8+ T細胞、double negative T細胞、proliferating T細胞、activated T細胞のサブセットに分類した。ウイルス抑制群と非抑制群で細胞群を比較すると、ウイルス感染で直接影響されるCD4+ T細胞に加え、proliferating T細胞の上昇が非抑制群で見られた。発現差異解析による解析では、抑制群と非抑制群で有意な差異は見られず、細胞の採取日時や凍結の影響が大きく、ウイルス抑制に特異的な遺伝子発現の特定には至らなかった。来年度以降、抗ウイルスに関連する遺伝子セットに絞った解析など、より詳細な解析を行なっていく予定である。

The aim of this study was to investigate the effects of anti-HIV-1 antibody administration on HIV-1 infection. HIV infection, anti-HIV antibody 3-fold injection and anti-HIV antibody 3-fold injection and anti-HIV antibody 3-fold injection In the past year, after antibody administration, single cell RNA sequencing was carried out, and cell group-specific RNA sequencing was carried out. This year, the new infection after 4 weeks of separation, 4 head of the first to take the analysis of the increase T-cell, B-cell, centroblast, cytocyte, plasmablast, NK cell, lymphocyte, myeloid DC, plasmacytoid DC, and innate lymphocyte cell populations are classified. T cells are classified as naive CD4 + T cells, central memory CD4 + T cells, T effector memory CD4 + cells, cellular helper CD4 + T cells, regulatory T cells, naive CD8 + T cells, effector memory CD8 + T cells, double negative T cells, proliferating T cells, activated T cells. Compared with the non-repressor group, the CD4 + T cells were directly affected by the infection, and the proliferating T cells were increased. Analysis of differences in occurrence, suppression, non-suppression, intentional differences in occurrence, cell acquisition, freezing, and inhibition, specific changes in occurrence, etc. In the coming year, we will analyze and analyze the relationship between them in detail.