シングルセルRNA-seqを用いた抗HIV抗体投与による寛解メカニズムの解析

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本研究の目的は、抗HIV-1抗体の投与によってHIV-1感染が寛解状態に至るメカニズムの解明である。 SHIV感染カニクイザル・モデルにおいて、抗HIV抗体の3回投与によってウイルス増殖を持続的に抑制したサルと、抑制しなかったサルが認められた。昨年度は、抗体投与後に採取したリンパ節のsingle cell RNA sequencingを行い、カニクイザルでの細胞群特定のマーカー 遺伝子の同定を行った。今年度は、新たに感染後4週のリンパ節を4頭のサルから採取して解析に加えた。また、新たなマーカー遺伝子を同定し、T細胞、B細胞、centroblast、centrocyte、plasmablast、NK細胞、単球、myeloid DC、plasmacytoid DC、innate lymphoid cellに細胞群を分類した。T細胞は、さらにnaive CD4+ T細胞、central memory CD4+ T細胞、T effector memory CD4+細胞、follicular helper CD4+ T細胞、regulatory T細胞、naive CD8+ T細胞、effector memory CD8+ T細胞、double negative T細胞、proliferating T細胞、activated T細胞のサブセットに分類した。ウイルス抑制群と非抑制群で細胞群を比較すると、ウイルス感染で直接影響されるCD4+ T細胞に加え、proliferating T細胞の上昇が非抑制群で見られた。発現差異解析による解析では、抑制群と非抑制群で有意な差異は見られず、細胞の採取日時や凍結の影響が大きく、ウイルス抑制に特異的な遺伝子発現の特定には至らなかった。来年度以降、抗ウイルスに関連する遺伝子セットに絞った解析など、より詳細な解析を行なっていく予定である。