权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

脊椎動物におけるglobal DNAメチル化の機能の解明

阐明脊椎动物整体 DNA 甲基化的功能

基本信息

批准号：
21K06013
负责人：
中村遼平
金额：
$ 2.75万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06013/
关键词：
DNAメチル化脊椎動物初期胚

项目摘要

DNAのメチル化(特にシトシンのメチル化)は植物、菌類、動物に広く見られるエピジェネティック修飾の一つであるが、生物種によってその機能やゲノム上の分布が異なる。脊椎動物は遺伝子のプロモーターなどを除くほとんどのゲノム領域がメチル化を受けるglobalメチル化というメチル化パターンを持つ。このglobalメチル化は脊椎動物種に特有のメチル化パターンであるが、その機能は明らかになっていない。その原因としてはDNAメチル化を除去する実験が困難であったことなどが挙げられる。本研究では、メダカ受精卵においてDNAメチル化を完全に除去できる独自の実験系によって脊椎動物におけるglobalメチル化の機能を明らかにする。特に、発生初期胚においてDNAメチル化を除去した場合の転写やクロマチン状態への影響を記載する。さらに、globalメチル化が非コード領域をマスクすることで転写因子が不要な調節領域を活性化するのを防ぐという仮説を実験的に検証する。まず、DNAメチル化が除去された場合にヒストン修飾がどのような影響を受けるかを検証した。ヒストンの修飾に対する抗体を用いてChIP-seqを行ったところ、ほぼ全ての修飾においてパターンに変化が見られたが、詳細な解析の結果、特にヒストンアセチル化が大きく影響を受けることがわかった。特に、異所的に生じるアセチル化領域からは新たに非コードRNAが転写されることも明らかになった。今後は、どのようなメカニズムでこのような修飾の変化が起きるのかを解明するための解析を行う。

DNA DNA fragmentation varies from plant, fungus, animal to biological species, and from biological species to biological functions. Vertebrate species are isolated from each other in the world. This global transformation is unique to vertebrate species, and its functions are clear. The reason for this is that it is difficult to remove DNA. This study is aimed at clarifying the function of DNA fusion in vertebrate cells by completely eliminating the unique DNA fusion of fertilized eggs. In particular, the early stages of embryonic development, DNA degradation, and the effects of DNA degradation were documented. In addition, the global network of non-governmental organizations, such as the United States, the United States, the United States, DNA modification is not only affected by DNA degradation, but also affected by DNA degradation. The results of the detailed analysis of the modified antibody using ChIP-seq are as follows: Special, different place of birth, the field of culture, the new, non-U. S. RNA, the future. In the future, we will analyze the changes in the structure of the system.