非コードDNAをコアとする核内構造体による転写制御のライブ観察駆動型数理研究

点击翻译按钮获取中文摘要

1. 細胞の転写制御を担う核内の動的な構造形成について、雌のマウスのES細胞が細胞分化を開始する際に起こす、X染色体同士の接近について、それを駆動する物理化学的メカニズムを明らかにした。この研究では、ES細胞から分化を開始する際に、X染色体内でのオープンクロマチン（ユークロマチン）と非オープンクロマチン（ヘテロクロマチン）の空間的配置が大きく変化し、それがX染色体が他の染色体と接する表面部分を柔らかなものに変化させることで、高分子の枯渇効果と同様のエントロピー力を起源とするX染色体同士の実効的な引力を惹起することを見出した（Komoto, et al., 2022）。2. ヒト培養細胞で観察されている、細胞環境に依存した核スペックルの様々な構造変化を再現する数理モデルを構築し、実験により核スペックル構造制御の主たる役割を担うと予想されている分子、SRRM2（タンパク質）, SON（タンパク質）, MALAT1（ノンコーディングRNA）, pre-mRNA、の間に働く実効的な相互作用を推定した（論文投稿中）。3. ヒトなどの細胞核内などでコヒーシンと共同して間期染色体の３次元構造の制御に携わっているCTCFの機能について、その構造と機能の進化的な保存性を考察するため、それらの祖先型生物であるウニのCTCFの機能解析を進めた。その結果、ウニのCTCFは内包するZinc Finger ドメイン数が哺乳類などに比べて少ないことや、分裂期染色体の構造制御に関与していることなどが見出された（論文準備中）。