スプライシング因子の核スペックル相互作用とその分子機構の解析
剪接因子核斑相互作用及其分子机制分析
基本信息
- 批准号:14770054
- 负责人:
- 金额:$ 1.47万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份:2002
- 资助国家:日本
- 起止时间:2002 至 2003
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1、HeLa細胞とHT1080細胞において、fibronectin, lch-1, elk1の内在性遺伝子を用いて熟ショックが選択的スプライシングに及ぼす影響について検討した。その結果、clk1にのみ熱ショックに応答してスプライシング様式の変換が見られた。37℃細胞培養時にはclk1野生型と、選択的スプライシングによりエキソン4が排除されたclk変異型の両産物がRT-PCR検出法で観察される。熱ショック処理を行うと、野生型のclk1産物のみが観察された。また、ヒトにはclk2,clk3というclk1類似遺伝子が存在し、clk1同様の選択的スプライシング様式があることから、これら遺伝子についても解析を行った。clk3は、clk1と同様に熱ショック応答性スプライシング様式の変換が見られたが、clk2では変化は見られなかった。さらにclk1のミニ遺伝子をSF2発現プラスミドと同時に細胞に導入すると、熱ショック時にSF2の発現量依存的にclk1野生型のスプライシング誘導を増加した。以上の結果は、熟ショック時に見られるclk1の分子変換にSF2の関与を示唆している。今のところ、直接的か間接的作用であるのかはわからないが、調節を受けるclk1のエキソン4上には予測上のSF2結合配列が複数存在する。2、エキソン結合部位複合体成分の一つであるRNPS1は核スペックル局在を示すスプライシング調節因子である。SF2との機能的相互作用が示唆されていることから、熱ショック、UV照射によるSF2様凝集効果をRNPS1で検討した。しかしながらストレス下でRNPS1の凝集は見られなかった。以前の解析でSRタンパク質の一つであるSC35も凝集がみられないことからストレス下ではSF2依存性標的遺伝子のみの分子変換が見られるものと考えられる。
1. HeLa cells and HT 1080 cells were examined for the presence and effects of intrinsic genes such as fibronectin, lch-1, elk1. As a result, clk1 's hot list changes to the list. When the cells were cultured at 37 ℃, the expression of clk1 wild-type and selected clk1 was detected by RT-PCR. Heat treatment was carried out, and wild-type clk1 products were detected. For example, if a clk2, clk3, clk1 similar signature exists, clk1 is the same as the selected signature, the signature is analyzed. clk3, clk1, clk2, clk3, clk4, clk3, clk3, clk4, clk3, clk3, clk4, clk4, clk3, clk4, clk In addition, the expression of clk1 gene in SF2 increased when the cell was introduced and the expression of clk1 wild-type gene increased when the cell was introduced. The above results show that the molecular transformation of clk1 is related to the transformation of SF2. Now, the direct and indirect effects are different, and the adjustment is different. The SF2 combination on the prediction is different. 2. The composition of RNPS 1 binding site complex is determined by the regulatory factors of RNPS 1 binding site complex. SF2 and functional interactions are discussed in the context of SF2 aggregation by heat, UV irradiation, and RNPS 1. The RNPS1 is a collection of condensed matter. The previous analysis showed that the SC 35 aggregation was the result of the SF2-dependent molecular transformation.
项目成果
期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Sakashita E.: "Human RNPS1 and its associated factors : a versatile alternative pre-mRNA splicing regulator in vivo."Mol.Cell.Biol.. 24・3. 1174-1187 (2004)
Sakashita E.:“人类 RNPS1 及其相关因子:体内多功能替代前 mRNA 剪接调节剂。”Mol.Cell.Biol.. 24・3(2004)。
- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kasashima K.: "Complex formation of the neuron-specific ELAV-like Hu RNA-binding proteins"Nucleic Acids Res.. 30・20. 4519-4529 (2002)
Kasashima K.:“神经元特异性 ELAV 样 Hu RNA 结合蛋白的复杂形成”《核酸研究》30・20(2002 年)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Tamada H.: "cDNA cloning and characterization of Drb1, a new member of RRM-type neural RNA-binding protein"Biochem Biophys Res Commun.. 297・1. 96-104 (2002)
Tamada H.:“RRM型神经RNA结合蛋白新成员Drb1的cDNA克隆和表征”Biochem Biophys Res Commun. 297・1 (2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Hayakawa M.: "Muscle-specific exonic splicing silencer for exon exclusion in human ATP synthase gamma-subunit pre-mRNA"J Biol Chem.. 277・9. 6974-6984 (2002)
Hayakawa M.:“用于人 ATP 合酶γ亚基前体 mRNA 中的外显子排除的肌肉特异性外显子剪接沉默子”J Biol Chem.. 277・9(2002)。
- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
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- 通讯作者:
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第 68 章碳水化合物代谢和 ATP,第 70 章蛋白质代谢,盖顿生理学,第 13 版(由 Yoshihiro Ishikawa、Koji Okamura、Tatsufumi Onaka 和 Kenji Kono 监督翻译),p767-777,p792-798
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