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核内構造を介した神経特異的遺伝子クラスターの共制御発現機構

通过核结构共同调节神经元特异性基因簇的表达机制

基本信息

批准号：
21K06122
负责人：
宮地まり
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

DNAトポイソメラーゼ (トポ )IIβはDNAの高次構造を変換する酵素で，私たちはトポIIβが一群の神経特異的遺伝子の発現を誘導，または抑制することを明らかにした.本研究では，トポIIβとゲノム上で共局在する因子であるhnRNP-U, CTCFに着目し，トポIIβによる神経特異的遺伝子の発現制御機構を明らかにすることを目的とする.トポIIβ，hnRNP-U，CTCFは，いずれもDNAにもRNAにも結合する活性がある. hnRNP-Uは，試験管内で，AT-richなS/MAR DNAに選択的に結合し，その結合にはN末に存在するSAPドメインが重要と考えられてきた．我々はhnRNP-U欠失変異体を用いてS/MAR DNA 結合活性を解析してC末に存在するRGドメインがS/MAR DNA 結合活性に重要であること，RGドメイン自体にS/MAR DNA結合活性があることを明らかにした．また，AT-rich DNAのminor grooveを認識するNetropsinが RGドメインのS/MAR DNA結合を選択的に阻害することから，RGドメインがAT-rich DNAのminor grooveを認識していることを明らかにした．RGドメインはRNA結合領域を含むことから，hnRNP-UのS/MAR DNA結合活性に対するRNAの効果を検証し，RNAが量依存的にhnRNP-UのS/MAR DNA結合活性を阻害することを明らかにした．細胞核内では，DNA,RNAが液―液相分離により機能的に分画されていることが予想されている．hnRNP-UのDNA/RNA結合活性がその制御に関わる可能性が示唆された(論文値投稿中)．

DNAトポイソメラーゼ (トポ)IIβはDNA's higher-order structure is used to replace enzymes, and private enzymes are used to induce and inhibit enzymes.にした. This study is based on では, トポIIβとゲノム, the common factor is であるhnRNP-U, CTCF,トポβによる神経Special legacy 伝子の発existing control mechanism を明らかにすることをPurpose とする. トポIIβ, hnRNP-U, CTCF は, いずれもDNA にもRNA にもcombination するActivity がある. hnRNP-U is in the test tube, AT-rich S/MAR DNA is selected and the binding is done, and the presence of the binding at the end of the N is very important and the SAP is very important. I did not analyze the binding activity of RNP-U due to the loss of the allogeneic S/MAR DNA, and analyzed the existence of the endogenous RNP-U S/MAR DNA. Binding activity is important, RG Autologous S/MAR DNA binding activity is important.また, AT-rich DNAのminor grooveをKnowing するNetropsinが RGドメインのS/MAR DNA binding を选択's blocking することから, RGドメインがAT-rich DNAのminor Groove ていることを明らかにした. RG ドメインはRNA binding field をcontaining むことから, hnRNP-UのS/MAR DNA binding activity に対するRNA の effect を検证し, RNA が quantity-dependent hnRNP-UのS/MAR DNA-binding activity is hindered by the blocking of the DNA binding activity. In the nucleus, DNA and RNA are liquid-liquid phase separation. The DNA/RNA binding activity of hnRNP-U is controlled by the possibility of control and the possibility is shown (the paper is under submission).

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

メダカDNAトポイソメラーゼIIβによる神経系の遺伝子発現制御

青鳉DNA拓扑异构酶IIβ对神经系统基因表达的调节

DOI：
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
0
作者：
Liu Shihui;Matsuo Toshihiko;Miyaji Mary;Hosoya Osamu;金子真也;原雄一郎;宮地まり，河野真二，細谷修，竹内秀明，筒井公子，筒井研
通讯作者：
宮地まり，河野真二，細谷修，竹内秀明，筒井公子，筒井研

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