Elucidation of evolutionary significance of vertebrate microchromosomes conserved for 400 million years

阐明保存了 4 亿年的脊椎动物微染色体的进化意义

基本信息

  • 批准号:
    21K06286
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

爬虫類や鳥類、軟骨魚類は、マイクロ染色体と呼ばれる微小な染色体を多数もっているが、真骨魚類や両生類、哺乳類のほとんどの種はマイクロ染色体をもたない。本研究では、多数のマイクロ染色体を保持する脊椎動物種において、核内の染色体高次構造を明らかにするとともに、新たに単離したマイクロ染色体特異的に増幅する反復配列における詳細な比較解析を行うことで、脊椎動物のマイクロ染色体について重要な進化学的知見を提供することである。2年目の昨年度では、四肢動物祖先から分岐したのちに独自にマイクロ染色体を消失した両生類において、データベースにて公開されている全ゲノム情報を用いて、各染色体末端特異的な分布を示す反復配列の同定を試みた。その結果、一部のカエルにおいて、染色体末端特異的に増幅する反復配列が見られなかったのに対して、ネッタイツメガエルでは複数種類の染色体末端特異的配列が検出された。このネッタイツメガエルにおける反復配列について、近縁種である異質倍数体種のアフリカツメガエルのゲノム中での保存性を検証したところ、ツメガエル2種間で染色体上の分布やコピー数が大きく異なっていることが明らかになった。このツメガエル2種間において、大きな染色体構造や遺伝子シンテニーはほとんど起きていないことが知られており、無尾両生類全体でもそれほど変化していないことがわかっているが、本研究から染色体末端の反復配列においてはツメガエル間や無尾両生類種間で独自に変化していることが明らかになった。
Reptiles, birds, cartilaginous fish, small chromosomes, teleostees, mammals, species, chromosomes This study provides insight into the high order structure of chromosomes in vertebrate species, the high order structure of chromosomes in the nucleus, and the high order structure of chromosomes in vertebrate species. In the past two years, the ancestors of tetrad animals have been separated from each other, and the chromosomes have disappeared. In the past two years, all the information has been used, and the specific distribution of each chromosome terminal has been shown. As a result, a number of species of chromosome terminal-specific alignment were detected. The distribution of chromosomes between the two species is verified by the preservation of heteroploid species. In this study, the repeated arrangement of chromosome termini in the two species was studied, and the chromosome structure in the two species was changed independently.

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Inference of evolution of vertebrate genomes and chromosomes from genomic and cytogenetic analyses using amphibians
  • DOI:
    10.11352/scr.24.3
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Y. Uno
  • 通讯作者:
    Y. Uno
全ゲノム解読における染色体解析の位置づけ:両生類や軟骨魚類から脊椎動物のゲノム・染色体進化をさぐる
染色体分析在全基因组解码中的地位:研究两栖动物和软骨鱼类脊椎动物的基因组和染色体进化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    KUMON Masanobu;NAKAE Shunsuke;MURAYAMA Kazuhiro;KATO Takema;OHBA Shigeo;INAMASU Joji;YAMADA Seiji;ABE Masato;SASAKI Hikaru;OHNO Yoshiharu;HASEGAWA Mitsuhiro;KURAHASHI Hiroki;HIROSE Yuichi;宇野 好宣
  • 通讯作者:
    宇野 好宣
Molecular cytogenetic characterization of C-band positive heterochromatin of the greater long-tailed hamster (Tscherskia triton, Cricetinae)
大长尾仓鼠(Tscherskia triton,仓鼠亚科)C带阳性异染色质的分子细胞遗传学特征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kamimura E;Uno Y;Yamada K;Nishida C;Matsuda Y
  • 通讯作者:
    Matsuda Y
ゲノム解析における細胞遺伝学的研究のあり方 -脊椎動物のゲノム進化研究の観点から-
基因组分析应如何进行细胞遗传学研究——从脊椎动物基因组进化研究的角度——
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    宇野 好宣
  • 通讯作者:
    宇野 好宣
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  • 通讯作者:
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