Exhaustive analyses on interrelationships among plant functional traits based on application of machine learning to an open access database

基于机器学习在开放访问数据库中的应用，对植物功能性状之间的相互关系进行详尽的分析

• 批准号: 21K06354
• 负责人: 饗庭 正寛
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Research Institute for Humanity and Nature
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06354/
• 关键词: 生物多様性; 機能形質; 機械学習; 機能的多様性; 植物群集

前年度に特定した重要な形質間関係のPartial dependence plotによる可視化を行った。その結果、形質間関係にはしばしば非線形の関係が見られることが示された。例えば草丈/樹高が1m以上の種においては草丈/樹高と種子重量の間に正の相関が見られたが草丈/樹高1m未満の種においてはそのような傾向は見られなかった。またFriedman’s Hの算出により２つの形質間関係に対する他の形質の影響を検証した。その結果、今回対象とした形質間関係においては最大で形質間関係で説明されるばらつきの30%程度が他の形質の値に依存したものであることが示された。例えば、葉の重量あたりリン含量と葉の重量あたり炭素含量の関係は葉の重量あたり窒素含量に依存して異なっていた。次に形質予測モデルに系統情報を追加した。系統情報のみを説明変数とするモデルと系統情報と形質の両方を用いたモデルを比較すると両方を用いたモデルの予測性能が大幅に高く、近縁種間においても形質間関係が重要であることが示された。また形質のみを説明変数とするモデルと系統情報と形質の両方を用いたモデルを比較すると両方を用いたモデルの予測性能がやや高くなっており今回のモデルに含まれずかつ系統的に保存された形質の重要性もしくは系統と形質の交互作用の存在が示唆された。Friedman’s Hの算出により２つの形質間関係に対する系統の影響を検証すると一部の形質間関係ではばらつきの20%程度が系統に依存していた。例えば、草丈/樹高と葉のサイズの正の相関は裸子植物では見られなかった。これらの発見は、これまで単相関関係ばかりが注目されてきた形質間関係研究に大きなインパクトを与えるのみならず人為撹乱が形質間関係を介して生態系機能に与える影響の予測性向上や機能的多様性評価における形質選択のガイドラインの提示など、応用研究においても幅広い活用が期待される。

In the previous year, it is possible to change the operation of the Partial dependence plot in the previous year in terms of the number of important data in different locations. The results of the test show that the data are not in the form of a message, and that the message is displayed. For example, if the height is more than 1m, the weight of the child is higher than 1m, the weight of the child is higher than 1m. Please Friedman's H to calculate that there is no difference between the two parts of the computer. The result of the experiment shows that this time it shows that the maximum size of the system is 30% higher than that of the other. For example, weight, carbon content, carbon content, asphyxiant content, asphyxiate content, asphyxi An additional information is added to the information report. The system information system shows that the performance of the system is significantly higher than that of the system system. This is an indication that there is a significant impact on the performance of the system in terms of the importance and importance of the system. Friedman's H calculates that the impact of the system on the system is 20% higher than that of the system. For example, gymnosperms, gymnosperms. We should pay close attention to each other and pay close attention to the study of the relationship between each other and the relationship between people and people in order to make an introduction to the ecological system for the measurement of sexual performance. The use of research, the scope of the study, the active use of the research, the expectation of the research, the use of the research and the active use of the research.