Lipidomics using isobaric mass tags: Development of analytical methodology for large scale samples

使用同量异位质量标签的脂质组学：大规模样品分析方法的开发

• 批准号: 21K06853
• 负责人: 徳岡 涼美
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K06853/
• 关键词: リピドミクス; 同重体タグ; イオンモビリティー; 質量分析; 脂質; 多検体

同重体タグを用いた測定系については、昨年に引き続きさらにターゲット成分を増加させる検討を行った。昨年度までにターゲット成分としていたのは、リン脂質のホスファチジルエタノールアミン（PE）、ホスファチジルセリン（PS）、遊離脂肪酸、脂質メディエータとなる脂肪酸代謝物、およびカルボキシを有する胆汁酸であった。本年はこれまでの測定ターゲットとしていた脂質以外にも、比較的m/zが小さく逆相クロマトグラフィーでの溶出時間が早い成分も検出されることに着目した。これまでの三連四重極型質量分析計を用いたSRM測定では、同時測定するターゲット数に制限が生じる。より多成分の同時測定を可能にする測定法として、三連四重極型質量分析計により各レポーターイオン6種類のプレカーサ―イオンスキャンを同時に行う測定系、及びイオンモビリティー分離を搭載したTOF型質量分析計による測定系の構築と運用について検討した。これらの系は多成分同時測定には適した系であるが、多検体測定後の解析スループットにはデータの解析においての課題が生じる事が確認できた。最終年度にはこの課題の克服に取り組むとともに、同重体タグを用いた多検体同時分析系の実検体分析の運用を進める予定である。また、昨年度に構築したイオンモビリティー分離を活用した3分間測定では1度に786検体の前処理と測定を行う実験系の運用を開始し、約4000検体の測定を行った。QC（クオリティコントロール）検体数を含めると5000検体以上の測定が実施されたことになる。QC検体を解析しこのような多検体セットの測定においても、約600ピークが安定して測定できることを確認した。この系においても実際に大規模なデータ解析を行うことについての課題が明確になったため実検体分析を進めつつ最適なデータ処理についての課題克服に取り組む。

The same weight is used in the determination of the composition of the sample. In the past year, the composition of lipids, lipids (PE), lipids (PS), free fatty acids, lipids, fatty acid metabolites, and bile acids have been studied. This year, we measured the dissolution time of the lipid fraction, compared the m/z ratio, and determined the dissolution time of the lipid fraction. This is the third quadrupole mass analyzer used in SRM determination and simultaneous determination. The simultaneous determination of multiple components is possible in a three-quadruple mass analyzer, and the simultaneous determination system and the TOF mass analyzer are carried out. The analysis of multi-component analysis results in the confirmation of multi-component analysis results. Finally, the application of multi-model simultaneous analysis system in solving this problem is scheduled. In the past year, the construction of the system has been started. The separation has been used for 3 minutes. The pre-treatment and measurement of 786 samples have been started. The measurement of 4000 samples has been started. The number of QC samples is 5000 or more. QC sample analysis and determination of multi-sample samples, about 600 samples, stable determination and confirmation This system is designed to solve large-scale problems in real time. It is designed to solve problems in real time. It is designed to solve problems in real time.

项目成果

非アルコール性脂肪性肝疾患の血漿マルチオミクス

非酒精性脂肪肝的血浆多组学

• 发表时间: 2022
• 作者: Kaori Endo-Umeda;Hiroyuki Nakashima;Shota Toyoshima;Shihoko Komine-Aizawa;Shuhji Seki;Makoto Makishima;徳岡 涼美
• 通讯作者: 徳岡 涼美