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Lipidomics using isobaric mass tags: Development of analytical methodology for large scale samples

Lipidomics using isobaric mass tags: Development of analytical methodology for large scale samples
使用同量异位质量标签的脂质组学:大规模样品分析方法的开发
批准号:
21K06853
负责人:
徳岡 涼美
金额:
$2.58万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

相关文献

中文摘要
翻译
同重体タグを用いた測定系については、昨年に引き続きさらにターゲット成分を増加させる検討を行った。昨年度までにターゲット成分としていたのは、リン脂質のホスファチジルエタノールアミン(PE)、ホスファチジルセリン(PS)、遊離脂肪酸、脂質メディエータとなる脂肪酸代謝物、およびカルボキシを有する胆汁酸であった。本年はこれまでの測定ターゲットとしていた脂質以外にも、比較的m/zが小さく逆相クロマトグラフィーでの溶出時間が早い成分も検出されることに着目した。これまでの三連四重極型質量分析計を用いたSRM測定では、同時測定するターゲット数に制限が生じる。より多成分の同時測定を可能にする測定法として、三連四重極型質量分析計により各レポーターイオン6種類のプレカーサ―イオンスキャンを同時に行う測定系、及びイオンモビリティー分離を搭載したTOF型質量分析計による測定系の構築と運用について検討した。これらの系は多成分同時測定には適した系であるが、多検体測定後の解析スループットにはデータの解析においての課題が生じる事が確認できた。最終年度にはこの課題の克服に取り組むとともに、同重体タグを用いた多検体同時分析系の実検体分析の運用を進める予定である。また、昨年度に構築したイオンモビリティー分離を活用した3分間測定では1度に786検体の前処理と測定を行う実験系の運用を開始し、約4000検体の測定を行った。QC(クオリティコントロール)検体数を含めると5000検体以上の測定が実施されたことになる。QC検体を解析しこのような多検体セットの測定においても、約600ピークが安定して測定できることを確認した。この系においても実際に大規模なデータ解析を行うことについての課題が明確になったため実検体分析を進めつつ最適なデータ処理についての課題克服に取り組む。
英文摘要
同重体タグを用いた測定系については、昨年に引き続きさらにターゲット成分を増加させる検討を行った。昨年度までにターゲット成分としていたのは、リン脂質のホスファチジルエタノールアミン(PE)、ホスファチジルセリン(PS)、遊離脂肪酸、脂質メディエータとなる脂肪酸代謝物、およびカルボキシを有する胆汁酸であった。本年はこれまでの測定ターゲットとしていた脂質以外にも、比較的m/zが小さく逆相クロマトグラフィーでの溶出時間が早い成分も検出されることに着目した。これまでの三連四重極型質量分析計を用いたSRM測定では、同時測定するターゲット数に制限が生じる。より多成分の同時測定を可能にする測定法として、三連四重極型質量分析計により各レポーターイオン6種類のプレカーサ―イオンスキャンを同時に行う測定系、及びイオンモビリティー分離を搭載したTOF型質量分析計による測定系の構築と運用について検討した。これらの系は多成分同時測定には適した系であるが、多検体測定後の解析スループットにはデータの解析においての課題が生じる事が確認できた。最終年度にはこの課題の克服に取り組むとともに、同重体タグを用いた多検体同時分析系の実検体分析の運用を進める予定である。また、昨年度に構築したイオンモビリティー分離を活用した3分間測定では1度に786検体の前処理と測定を行う実験系の運用を開始し、約4000検体の測定を行った。QC(クオリティコントロール)検体数を含めると5000検体以上の測定が実施されたことになる。QC検体を解析しこのような多検体セットの測定においても、約600ピークが安定して測定できることを確認した。この系においても実際に大規模なデータ解析を行うことについての課題が明確になったため実検体分析を進めつつ最適なデータ処理についての課題克服に取り組む。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Kaori Endo-Umeda, Hiroyuki Nakashima, Shota Toyoshima, Shihoko Komine-Aizawa, Shuhji Seki, Makoto Makishima, 徳岡 涼美]
通讯作者: 徳岡 涼美