Study on the mechanism of oncogene activation by structural variants in cancer genome

癌症基因组结构变异激活癌基因的机制研究

• 批准号: 21K08171
• 负责人: 佐々木 高明
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Asahikawa Medical College
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K08171/
• 关键词: ゲノム構造異常; 遺伝子解析; MET遺伝子のエクソン14欠失変異; ドライバー遺伝子; がんゲノム; ナノポアシーケンシング; ドライバー遺伝子変異; 薬剤耐性; 肺癌; 融合遺伝子

がんは、ゲノムの異常によって発生する疾患です。その異常部分を解析することで、発症原因を特定し、具体的な治療法を開発することが可能になります。現代の医学では、高度な技術を用いてゲノムの解析が行われ、その結果を基に患者の診断や治療が進められています。しかしながら、技術の進歩にもかかわらず、全ての遺伝子異常が検出できるわけではありません。一部の異常は依然として検出が難しく、その存在が治療法の開発を阻害する要因となっています。特に、未知の融合遺伝子や選択的スプライスバリアントによるエクソン欠失、繰り返し配列といったゲノム構造異常は、従来の遺伝子解析では検出されず、その解明が大きな課題となっています。本研究では、この難題に挑戦し、特に肺癌細胞に焦点を当ててゲノム構造異常ががん遺伝子の活性化にどのように影響するかを詳細に解析します。具体的には、がん細胞の細胞膜上に発現する受容体型チロシンキナーゼというターゲットに注目し、その遺伝子解析を進めています。この中でも特にMET遺伝子のエクソン14欠失変異は、ゲノムに大きな構造異常を引き起こすとの報告があり、本研究ではその異常を検出できる実験系を確立することに注力しています。これにより、MET遺伝子異常をもつ肺癌細胞の特性を詳細に理解し、それに基づいた治療法を開発することが可能になると期待されています。将来的には、ドライバー遺伝子陰性の肺癌細胞株や、EGFR, HER2, BRAF, KRAS, ALK, ROS1, RETなどのドライバー遺伝子陽性で薬剤耐性のメカニズムとしてのゲノム構造異常を研究します。新たなゲノム構造異常の検出方法が開発されれば、それに対応する新しい治療法の開発につながります。

Youdaoplaceholder0 がん and ゲノム are abnormal によって, which leads to する disease です. Analytical す そ の abnormal part を る こ と で, 発 cause を し, specific な therapy を 発 す る こ と が may に な り ま す. Modern medical で の は, highly な technology を い て ゲ ノ ム の parsing line が わ れ, そ の results を に や の diagnosis treatment が into め ら れ て い ま す. し か し な が ら, technology の into step に も か か わ ら ず, whole て の heritage 伝 child abnormal が 検 out で き る わ け で は あ り ま せ ん. An abnormal の は still と し て 検 out が difficult し く, そ の is の が therapy open 発 を resistance against す る by と な っ て い ま す. に, unknown の fusion heritage 伝 や son of sentaku ス プ ラ イ ス バ リ ア ン ト に よ る エ ク ソ ン owe loss, Qiao り return し match column と い っ た ゲ ノ ム structural abnormalities は, 従 to の heritage 伝 son parsing で は 検 out さ れ ず, そ の interpret が big き な subject と な っ て い ま す. This study で は, こ の problem に pick 戦 し, special focus に を に lung cancer cells when て て ゲ ノ ム tectonic anomaly が が ん posthumous son 伝 の activeness に ど の よ う に influence す る か を detailed analytical し に ま す. Specific に は, が の ん cell membrane に 発 now す る by capacity size チ ロ シ ン キ ナ ー ゼ と い う タ ー ゲ ッ ト に attention し, そ の heritage 伝 son parsing を into め て い ま す. In こ の で も, に MET heritage 伝 son の エ ク ソ ン 14 owe lost - different は, ゲ ノ ム に big き な tectonic anomaly を lead き up こ す と の report が あ り, this study で は そ の abnormal を 検 out で き る be を 験 department establish す る こ と に note force し て い ま す. こ れ に よ り, MET but 伝 abnormal を も つ lung cancer cells の features を に detailed understanding し, そ れ に base づ い た therapy を open 発 す る こ と が may に な る と expect さ れ て い ま す. Future に は, ド ラ イ バ ー heritage 伝 negative の lung cancer cell lines や, EGFR, HER2, mutated BRAF, KRAS, ALK, ROS1, RET な ど の ド ラ イ バ ー posthumous son 伝 positive で 薬 tonic patience の メ カ ニ ズ ム と し て の ゲ ノ ム tectonic anomaly を research し ま す. New た な ゲ ノ ム tectonic anomaly の 検 out method が open 発 さ れ れ ば, そ れ に 応 seaborne す る new し い therapy の open 発 に つ な が り ま す.