Integrative proteomic analysis of PDX models to develop targeted therapies in gastric cancer

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早期胃癌の多くは根治が期待できるのに対し、遠隔転移を伴う進行胃癌はもっとも予後が不良な固形癌のひとつである。近年のゲノム解析技術の目覚ましい進歩にもかかわらず、進行胃癌の有効な化学療法は限られており、革新的なアプローチによる新規治療法の開発が急務である。そこで、本研究では、プロテオミクスを用いた革新的なアプローチによって、胃癌の克服に取り組む。細胞表面タンパク質は、癌において機能的に重要な役割を果たしているだけでなく、その局在から、直接的な治療標的としても非常に有望である。細胞表面タンパク質は細胞内タンパク質に比べて極めて微量であることから、本研究では胃癌患者から外科手術によって採取された腫瘍検体を用いて患者腫瘍組織移植（patient-derived xenograft; PDX）モデルを樹立し、PDX腫瘍を用いてHLAクラスI結合ペプチド（HLAリガンドーム）を含めた細胞表面タンパク質（サーフェスオーム）解析を行う。現在までに、胃癌14症例についてPDXモデルを作成し、このうち9症例においては、さらに患者腫瘍由来細胞株（PDC）を樹立できた。またHLAリガンドーム解析から同定された免疫原性の高いHLAクラスI結合ペプチドについて検証を行うために、rIL-2を用いた腫瘍浸潤リンパ球の分離培養も行った。8症例において、PDXモデルと腫瘍浸潤リンパ球がペアとして得られている。現在各PDX腫瘍のエクソーム解析、RNAシーケンス解析、プロテオーム解析を進めている。