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Analysis of immune microenvironment-related germline variants in gliomas

神经胶质瘤中免疫微环境相关种系变异的分析

基本信息

批准号：
21K09100
负责人：
杉生憲志
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Okayama University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K09100/
关键词：
グリオーマ germline PIK3R1 神経膠腫微小環境

项目摘要

グリオーマは予後不良な脳腫瘍であり, その中で最も悪性度の高いグリオブラストーマの5年生存率はわずか10％である. 近年, 腫瘍細胞でのみ生じるsomatic（体細胞）遺伝子変異の解析が進んでいるが, 患者が生まれながらに持ち, 体内のすべての細胞で生じるgermline（生殖細胞系列）バリアントについては未だ不明な点が多い. 本邦で開発され, ノーベル賞にも輝いた免疫チェックポイント阻害剤をはじめとする様々な免疫療法が実臨床に応用されているが, グリオーマに対しては有効性を示せていない. 免疫療法の有効性を決定する要素の一つとして, 腫瘍の免疫微小環境が注目されているが, 体内の全細胞に存在するgermlineバリアントは, 腫瘍細胞のみならず免疫微小環境にも強い影響を与える可能性がある. しかし, germlineバリアントと, グリオーマの予後や免疫微小環境との関連に着目して解析を行ったという報告はこれまでにほとんどない. 本研究では, TCGAのゲノム配列データを用いて, PIK3R1 Met326Ile germline変異がグリオーマの発生率, 予後, さらには免疫微小環境に与える影響について解析を行う. PIK3R1 M326Ileのホモ変異型 (PIK3R1 M326Ile Homo MT)は, 予後が悪い傾向はあるが, ３群解析で有意差はつかず（Homo MT vs WT + Hetero MTで比較すると有意差あり）, BLACK OR AFRICAN AMERICANで有意に多いことがわかった. また, 人種ごとに解析した場合も, PIK3R1 M326IleのHomo MTは, 予後が悪い傾向はあることがわかった. 人種ごとに健常人とGBMで比較すると, PIK3R1 M326Ile変異は, 疾患発症リスクには関与しないといいうことがわかった. ホモ変異型 (PIK3R1 M326Ile Homo MT)では, MTAPやIFNの変異が多く, PIK3R1 M326Ile変異が免疫微小環境に影響を与える可能性が示唆された.

The 5-year survival rate is 10%. In recent years, tumor cells have been born with somatic (somatic) genes, and the analysis of genetic differences has been progressing. Patients have been born with different genes, and the germline of cells in vivo has been born with different genes. We have developed immunotherapy for clinical use, and we have developed immunotherapy for clinical use, and we have developed immunotherapy for clinical use. Immunotherapy is effective in determining the factors, tumor immune microenvironment attention, the whole cell in the body exists in the germline, tumor cells in the immune microenvironment strong influence and possibility. The germline is a very important part of the immune microenvironment. In this study, TCGA was used to analyze the effects of PIK3R1 Met326Ile germline on the survival rate of TCGA. PIK3R 1 M326 Ile Homo MT is a new type of MT. It is a new type of MT. PIK3R1 M326Ile Homo MT is a new type of MT. In this case, PIK3R1 M326Ile no Homo MT, I am inclined to be. When comparing race with healthy people and GBM, the PIK3R1 M326Ile is different, and the disease and symptoms are related to it. Mirabilis (PIK3R1 M326Ile Homo MT) is a variant of MTAP IFN, and PIK3R1 M326Ile is a variant of MTAP IFN.