膠芽腫のメチル化プロファイルに応じた治療効果予測とエピゲノム個別化療法の創出

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研究代表者が以前の研究でメチル化アレイ解析を行った130例の神経膠腫の中から膠芽腫43例の臨床データを収集し、予後と関連のあるメチル化部位、遺伝子を抽出した。上位の遺伝子群をgene ontology解析したところ、細胞周期関連でアノテーションされた遺伝子のエンリッチメントがみられた。TCGA(The Cancer Genome Atlas)のデータベースから入手できる膠芽腫のメチル化データを用いて検証を行ったところ、同様の結果が得られた。さらにvalidationするために、当院にて手術を行った膠芽腫の腫瘍検体および培養細胞を用いた解析を行うこととした。膠芽腫からの腫瘍DNA抽出および培養細胞の樹立を行い、メチル化アレイ解析を行ったところ、メチル化アレイによるサブグループと予後との相関が得られた。テモゾロミドやアバスチンの治療効果との関連について、今後さらなる解析を予定している。また、神経膠腫の患者血清および髄液からdigital PCRにより微量な腫瘍由来DNAを抽出し、IDH変異、TERTプロモーター変異、MGMTメチル化について腫瘍検体との比較を行い高い相関を得た。これらliquid biopsyでは、メチル化アレイ解析を行えるほどのDNA量は得られなかったものの、非侵襲的な方法で膠芽腫のメチル化分類を行い、早期に有効な治療を選択するための礎となるデータが得られたと考える。今後、メチル化(エピジェネティック)プロファイルに応じた治療効果の検証後、治療効果を加えたメチル化分類を構築し、膠芽腫検体の再分類を行う予定である。