miRNA発現パターンと病理所見に基づく機械学習による冠動脈硬化症のクラスター化

アテローム性動脈硬化症はよく見られる血管疾患であり、冠動脈疾患(CAD)は心臓の血管の疾患です。動脈硬化性CADは年齢とともに増加する傾向があり、一般的で致命的な心血管疾患と考えられています。既知のmiRNAに関するCAD危険因子の中で、Has-miR-143及びHas-miR-146aについて数多く報告されました。最近、これらのmiRNAをコードする遺伝子rs41291957及びrs2910164のGenotypingの種類とCAD発病のリスクと関係することが明らかになりました。しかし、日本人集団に関する報告はほとんどないので、本研究は法医学解剖事例を試料として冠状動脈硬化の状況を観察したうえで血液を採取しmiRNAの発現量を測定するとともにその対応するSNP遺伝子のパターンも解析しました。血漿からRNAを精製し、逆転写によりcDNAを得られTaqMan assay法を用いmiRNAの発現量を測定しました。さらにmiR-143とmiR-146aについてそれぞれ関連する遺伝子rs41291957及びrs2910164をターゲットとしてTaqMan SNPアッセイを使用して2つのSNP遺伝子座のGenotypingを調べました。解剖所見と顕微鏡観察により151人の試料を解析しました。主冠動脈、前下行枝、回旋動脈、および右冠動脈の閉塞の程度を評価するためにImageJソフトウェアを使用して、アテローム硬化性閉鎖が10% 未満 (コントロール) および 10% を超える2つのグループに分かれて分析しました。その結果、後者はコントロールグループよりrs2910164 CC遺伝子型は多く確認されたことで研究集団におけるCADのリスクと関連していたことが示唆されました。ただし、Has-miR-143 rs41291957遺伝子型は、CADリスクとの明確な関連性を示しませんでした。

アテローム性動脈硬化症はよく見られる血管疾患であり、冠動脈疾患(CAD)は心臓の血管の疾患です。動脈硬化性CADは年齢とともに増加する傾向があり、一般的で致命的な心血管疾患と考えられています。既知のmiRNAに関するCAD危険因子の中で、Has-miR-143及びHas-miR-146aについて数多く報告されました。最近、これらのmiRNAをコードする遺伝子rs41291957及びrs2910164のGenotypingの種類とCAD発病のリスクと関係することが明らかになりました。しかし、日本人集団に関する報告はほとんどないので、本研究は法医学解剖事例を試料として冠状動脈硬化の状況を観察したうえで血液を採取しmiRNAの発現量を測定するとともにその対応するSNP遺伝子のパターンも解析しました。血漿からRNAを精製し、逆転写によりcDNAを得られTaqMan assay法を用いmiRNAの発現量を測定しました。さらにmiR-143とmiR-146aについてそれぞれ関連する遺伝子rs41291957及びrs2910164をターゲットとしてTaqMan SNPアッセイを使用して2つのSNP遺伝子座のGenotypingを調べました。解剖所見と顕微鏡観察により151人の試料を解析しました。主冠動脈、前下行枝、回旋動脈、および右冠動脈の閉塞の程度を評価するためにImageJソフトウェアを使用して、アテローム硬化性閉鎖が10% 未満 (コントロール) および 10% を超える2つのグループに分かれて分析しました。その結果、後者はコントロールグループよりrs2910164 CC遺伝子型は多く確認されたことで研究集団におけるCADのリスクと関連していたことが示唆されました。ただし、Has-miR-143 rs41291957遺伝子型は、CADリスクとの明確な関連性を示しませんでした。