Development and Implementation of Accurate and Fast Arbitrary Shaped Cluster Detection Method

准确快速的任意形状簇检测方法的开发与实现

• 批准号: 21K11791
• 负责人: 大谷 隆浩
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Nagoya City University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K11791/
• 关键词: 空間疫学; スキャン統計量; 空間データ; クラスター; 疾病集積性; Cluster Detection Test

位置情報を付加した空間医学データをもとに疾病の発生との関連が強い箇所 (クラスター) を検出しその統計的有意性を判定する方法として，最大尤度比に基づくスキャン統計量が提案され，空間疫学研究や症候サーベイランスなどの分野で重要なツールになっている。本研究では多様な形式の空間データから精確に複数のクラスターを検出し，その統計的有意性を適切に判定する統計解析ソフトウェアについて検討する。新たなソフトウェアを開発するとともに，空間疫学研究の大規模な実データを用いた実証研究を行うことでその有効性の評価を行う。2022年度は，前年度までに開発した複数のクラスターの検出と統計的有意性の評価を行う解析ソフトウェアについて，並列処理による高速化を検討した。空間スキャン統計量は原則として一つのクラスターのみを検出し有意性を評価するが，実際にはクラスターが複数ある場面も多い。このような場合に，情報量基準の視点から適切な集積期間の数を選択してそれらを同定し，全体としての統計的有意性の評価を行う手法 (Takahashi & Shimadzu, 2018) が提案され，計算機シミュレーションにより有効性が示されている。この手法を用いて疾病の地域集積性および時間集積性を検出する解析ソフトウェアを前年度までに開発してきたが，データが大きくなるにつれて計算時間がかかることが問題となっていた。そこで，並列処理による高速化を行い，計算機実験によりその有効性を確認した。さらに，空間疫学研究においてはリスクの高い地域だけでなく低い地域についても検出できることが望ましいため，これまでに開発してきた統計解析ソフトウェア「R」用パッケージを拡張し，疾病の発生が少ない地域を検出する機能を実装してオープンソースソフトウェアとして公開した。

Location intelligence を plus し た space medicine デ ー タ を も と に disease の 発 raw と の masato even by strong が い a (ク ラ ス タ ー) を 検 out し そ の statistics to sexual を determine す る method と し て, maximum especially degree than に base づ く ス キ ャ ン statistic が proposal さ れ, Spatial epidemiology research や symptoms サ ー ベ イ ラ ン ス な ど の eset で important な ツ ー ル に な っ て い る. This study で は many others な form の space デ ー タ か ら precise に plural の ク ラ ス タ ー を 検 し, そ の statistics to sexual を appropriate に determine す る statistical parsing ソ フ ト ウ ェ ア に つ い て beg す 検 る. New た な ソ フ ト ウ ェ ア を open 発 す る と と も に, spatial epidemiology studies の large な be デ ー タ を with い た line card be research を う こ と で そ の have sharper sex の review 価 う を line. Before 2022 annual は, annual ま で に open 発 し た plural の ク ラ ス タ ー の 検 out と statistics intentionally の review 価 を line う parsing ソ フ ト ウ ェ ア に つ い て, tied for 処 Richard に よ high speed る を beg し 検 た. Space ス キ ャ は ン statistics principle と し て a つ の ク ラ ス タ ー の み を 検 out し intentionally を review 価 す る が, be interstate に は ク ラ ス タ ー が plural あ る scene も い more. こ の よ う に な situations, amount of intelligence benchmark の viewpoints か ら appropriate な set number の during product を sentaku し て そ れ ら を し, with all the と し て の statistics to sexual の review 価 を line う technique (Takahashi & Shimadzu, 2018) proposed が さ れ, The computer シ シ ュレ シ ショ ショ ショ ショ によ によ ュレ is effective for が to show されて る る. こ の gimmick を with い て disease の region set multiplicative お よ び time set multiplicative を 検 out す る parsing ソ フ ト ウ ェ ア を before annual ま で に open 発 し て き た が, デ ー タ が big き く な る に つ れ て computing time が か か る こ と が problem と な っ て い た. Youdaoplaceholder0 そ で で, concurrently processing による high-speed を lines そ, computer experiments によ そ そ effectively を confirm that た. さ ら に, spatial epidemiology research に お い て は リ ス ク の high regional だ い け で な く low い regional に つ い て も 検 out で き る こ と が hope ま し い た め, こ れ ま で に open 発 し て き た statistical parsing ソ フ ト ウ ェ ア "R" with パ ッ ケ ー ジ を company, zhang し, Less disease の 発 raw が な い regional を 検 out す る function を be loaded し て オ ー プ ン ソ ー ス ソ フ ト ウ ェ ア と し て public し た.

项目成果

化学物質流出・拡散を想定した迅速対応統合プラットフォームの開発

开发假设化学物质泄漏/扩散的快速响应综合平台

• 发表时间: 2022
• 作者: 大谷隆浩;高橋邦彦;菱田朝陽;若井建志;浅見真理
• 通讯作者: 浅見真理

疾病の時間集積性を解析するためのRパッケージの開発と評価

用于分析疾病时间累积的 R 包的开发和评估

• 发表时间: 2022
• 作者: 大谷隆浩;高橋邦彦
• 通讯作者: 高橋邦彦

Social functions and adverse outcome onset in older adults with mild long-term care needs: A two-year longitudinal study

• DOI: 10.1016/j.archger.2022.104631
• 发表时间: 2022-02-01
• 期刊: ARCHIVES OF GERONTOLOGY AND GERIATRICS
• 影响因子: 4
• 作者: Noguchi, Taiji;Nakagawa, Takeshi;Saito, Tami
• 通讯作者: Saito, Tami

rflexscan: The Flexible Spatial Scan Statistic

rflexscan：灵活的空间扫描统计

Coffee and metabolic phenotypes: A cross-sectional analysis of the Japan multi-institutional collaborative cohort (J-MICC) study

• DOI: 10.1016/j.numecd.2022.12.019
• 发表时间: 2023-02-15
• 期刊: NUTRITION METABOLISM AND CARDIOVASCULAR DISEASES
• 影响因子: 3.9
• 作者: Watanabe，Takeshi;Arisawa，Kokichi;Matsuo，Keitaro
• 通讯作者: Matsuo，Keitaro