Population genomic studies of social evolution

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社会性の進化に関わるゲノム領域を特定することは、その進化の法則を探る上で重要である。昆虫を始めとした社会性生物では、多様な種におけるゲノム解読が進んでいるものの、集団間にはたらくゲノムレベルでの自然選択の検出に関しては、解析が不十分である。本研究課題では、社会性アブラムシにおいて複数集団・複数個体の全ゲノム配列を取得し、集団の歴史を考慮した集団ゲノミクス解析を行うことで、社会性進化に関与したとされるゲノム領域を特定する。2022年度は、前年度に引き続き、日本全国に分布するボタンヅルワタムシColophina clematisの地域集団（東北・関東・中部・中国・九州地方）において、1次宿主植物世代・2次宿主植物世代から採集を行い、その中の遺伝的に異なる個体からDNAを抽出し、ライブラリーを調製後、全ゲノムの再シーケンス解析を行った。得られた計60個体の塩基配列情報から集団内のSNPデータを取得し、集団構造・動態の推定をおこなった。また、Hi-Cライブラリーを調製後、シーケンスを行い、領域間の空間的な近接性を解析することで、すでにある参照ゲノムから染色体スケールでのゲノムスキャフォールディングを行った。その結果、大部分の領域が実際の染色体数（2n = 10）と同数の空間的に近接した27-101Mbのグループに分配された。また、オスとメスの胚からゲノム抽出を行い、それぞれのゲノム配列をシーケンス解析し、上記のゲノム配列にマッピングすることで、性染色体の配列を特定した。