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異数化が関与すると推定される“無性時代”酵母の多様性獲得の仕組みの解明

阐明酵母在“无性时期”获得多样性的机制，推测该时期涉及非整倍性

基本信息

批准号：
20K06801
负责人：
高島昌子
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Tokyo University of Agriculture
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ドラフトゲノム解析を行った担子菌酵母Cutaneotrichosporon cavernicola（Trichosporonales目、担子菌類ハラタケ亜門）と関連菌株のうち、ゲノムサイズが約20Mbの5株について解析を進めた。本種のタイプであるHIS19とこれとは少し異なることが推定されていたHIS471の2株については追加のゲノム解析を実施し、高品質なゲノムを得た。アセンブリの結果、ほぼ染色体完全長コンティグを得ることができ、また染色体数は7本と推定された。シンテニー解析により、HIS019、HIS002、HIS631、およびHIS641の4株は概ね同様の染色体構造を持っていると推定された。これに対しHIS471は、HIS019等と比較すると20か所以上の転座・逆位などの染色体構造変化が存在していた。一方で、これら5株の菌類簡易同定の指標であるバーコード配列（ITS領域）は一致していた。子嚢菌酵母ではSaccharomyces属の種間やCandida albicansとC. dubliniensisなど極めて近縁な種間では、シンテニーはよく保存されていると報告されている。本結果は、種の境界を推定する際に用いられるバーコード領域の類似度とゲノムシンテニーの関連についての新たな知見につながるものと考えられるため、ハイブリッドゲノム株との関係も含めて、さらに詳細に調べる予定である。本内容を、日本農芸化学会2023年度大会で報告した。また、当初予定していたセルアナライザーを用いた観察を実施できる体制を整えた。現在、解析に向け、培養条件や固定方法等の条件検討を行っている。

The analysis of basidiomycete yeast Cutaneosporon cavernicola (Trichosporonales, basidiomycetes) and related strains reached about 20Mb. This species is estimated to have two strains of HIS471, and the analysis of additional species is carried out to obtain high quality plants. The number of chromosomes is estimated to be 7. The chromosome structure of four strains of HIS019, HIS002, HIS631 and HIS641 was analyzed and estimated. The chromosome structure of HIS471, HIS019, etc. is different from that of HIS471 and HIS019. The index of simple identification of 5 strains of fungi in a square is consistent with that of ITS field. Candida albicans C. Dubliniensis is the most important species in the world. The results show that the similarity of the domain of the species and the relationship between the species and the species are determined in detail. Report of the 2023 Annual Conference of Japan Agricultural Chemical Society In the beginning, the system was adjusted according to the requirements of the system. Now, analysis direction, culture conditions, fixation methods and other conditions are discussed.