がん細胞のリボソーム構成タンパク質の発現解析と転写後調節への関与

c-myc遺伝子転写抑制因子FIR(Far-upstream element-binding protein-interacting repressor)（別名PUF60）がc-myc遺伝子の発現増大をもたらす機序として、FIRの転写抑制部位のexon 2を欠損したスプライシング変異 (FIRΔexon2) が発現し、ドミナントネガティブ効果によりc-myc遺伝子の転写が活性化していることを見出した。本研究ではさらにFIRおよびFIRΔexon2タンパク質がリボソームRNAの発現変化に関与していることをRNA-seqにより同定した。すなわちFIRおよびFIRΔexon2は転写、選択的スプライシングやリボソーム形成などにも関与している多機能分子と考えられる。リボソームの構成タンパク質が癌細胞や希少疾患において正常細胞と異なっていることが報告されている。本研究では、がん細胞において、FIRおよびFIRΔexon2が多くのリボソームタンパク質の発現（rRNAやRPレベル）に影響を与えることをRNA-Seqで調べた。その結果、FIRはリボソームの発現に関与していることが示唆された。そのため、FIRΔexon2はがん細胞におけるリボソームの転写の不均一性に関与していると考えられた。癌や希少疾患のリポソームタンパク質の構成の発現量や組み合わせの変化、あるいは構成するリボソームタンパク質の遺伝子変異などが起こっていることが報告されているが、臨床検体における詳細は不明の点が多い。本研究ではリボソーマルタンパク質をmRNA, タンパク質レベルで検出する系を作製して検討を行った。

c-myc遺伝子転写抑制因子FIR(Far-upstream element-binding protein-interacting repressor)（別名PUF60）がc-myc遺伝子の発現増大をもたらす機序として、FIRの転写抑制部位のexon 2を欠損したスプライシング変異 (FIRΔexon2) が発現し、ドミナントネガティブ効果によりc-myc遺伝子の転写が活性化していることを見出した。本研究ではさらにFIRおよびFIRΔexon2タンパク質がリボソームRNAの発現変化に関与していることをRNA-seqにより同定した。すなわちFIRおよびFIRΔexon2は転写、選択的スプライシングやリボソーム形成などにも関与している多機能分子と考えられる。リボソームの構成タンパク質が癌細胞や希少疾患において正常細胞と異なっていることが報告されている。本研究では、がん細胞において、FIRおよびFIRΔexon2が多くのリボソームタンパク質の発現（rRNAやRPレベル）に影響を与えることをRNA-Seqで調べた。その結果、FIRはリボソームの発現に関与していることが示唆された。そのため、FIRΔexon2はがん細胞におけるリボソームの転写の不均一性に関与していると考えられた。癌や希少疾患のリポソームタンパク質の構成の発現量や組み合わせの変化、あるいは構成するリボソームタンパク質の遺伝子変異などが起こっていることが報告されているが、臨床検体における詳細は不明の点が多い。本研究ではリボソーマルタンパク質をmRNA, タンパク質レベルで検出する系を作製して検討を行った。