Investigation on the origin of human Strongyloides focusing on sampling from primates

点击翻译按钮获取中文摘要

霊長目動物を宿主とする3種の糞線虫属線虫 (Strongyloides stercoralis, S. fuelleborni, S. cebus)の糞線虫属全体における系統学的位置の詳細を明らかにするために、既存サンプルおよび、国内で本年度実施されたサンプリングにより新規に取得された様々な宿主に由来する糞線虫属線虫illumina Miseqシーケンサによるゲノム情報の取得を行った。新たにゲノム情報が得られたのは以下の糞線虫種である：①ミーアキャット由来糞線虫 [動物病院患動物] (新種と推定)、②アルマジロ由来糞線虫 (S. dasypodisと推定)、③イエアメガエル[動物病院患動物] 由来糞線虫、④シマヘビ [宮﨑県、野生捕獲]由来糞線虫 (S. mirzaiと推定)、⑤ホンハブ[鹿児島県・野生捕獲個体] 由来糞線虫 、⑥ヌートリア由来糞線虫[島根県・外来種、野生化個体] (S. myopotamiと推定)。系統解析に有用な核ゲノムマーカーの選択のため、全ゲノム情報が明らかになっている４種の糞線虫種ならびに２種の近縁種の配列情報を利用した。Single-copy orthologous geneの中から最終的に11のマーカー遺伝子を選択した。そして、様々な宿主動物に由来する糞線虫種に関し、targeted assembly of sequence readsの手法でマーカー遺伝子配列を取得した。ミトコンドリアゲノム並びに核ゲノム配列情報に基づく系統樹を作成した。系統樹上、3つのグループ (Stercoralis-Procyonis group, Papillosus group, Reptile-Amphibian infecting group) が認められ、これらのグループへと至る種分化は糞線虫属線虫の進化史における初期段階に起こったことが推定された。