核内低分子RNA snRNAU2関連断片の機能解明と肺癌予後マーカーとしての評価

小核RNA snRNAU2相关片段的功能阐明和作为肺癌预后标志物的评估

• 批准号: 20K07791
• 负责人: 相磯 聡子
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Kyorin University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K07791/
• 关键词: miR-1246; RNU2-1; コピー数多型; バイオマーカー; 偽遺伝子; 肺腺癌; snRNA; qPCR; miRNA; microRNA; スプライソソーム

snRNA U2遺伝子（RNU2-1）のコピー数多型解析法の改良：当遺伝子のコピー数多型は数～数十以上と非常に幅があるため、リアルタイムPCR法による比較定量キットでは正確な結果を得ることは困難で、絶対定量を行う必要があった。令和3年度はこの条件設定を行い健常人検体のコピー数解析を行ったが、この方法は煩雑で、誤差が生じやすかった。そのため令和4年度はデジタルPCR法を用いる方向で改めて条件検討を行い、健常者DNAについてデータを得た。リアルタイムPCR法を用いた場合とほぼ同じ結果であったが、得られたデータの信頼性は高くデータ取得に要する時間は大幅に短縮することができた。肺癌患者検体の収集は本学医学部付属病院において行うことを計画していたが、バイオバンクより提供を受けるため新たに倫理審査申請を行った。snRNA断片の定量における交叉反応の可能性の解析：データベース情報によれば、miR-1246（snRNA U2断片）の塩基配列は少なくとも6種のsnRNA U2偽遺伝子に保存されている。本研究で注目しているpseudo U2断片（偽遺伝子RNU2-2Pに由来）の塩基配列については他には相同配列が見られないことが分かった。これは疾患マーカーとして有利な点である。miR-1246 isoformに関する解析：既存の肺癌患者血清を用いた解析により、肺腺癌患者の血中miR-1246レベルの上昇は、miRBase型ではなく5’末端が2塩基短いisoformの上昇によるものであることを明らかにし報告した（Aiso T & Ueda M. Mol Med Rep 27:12979, 2023）。この成果はmiR-1246の標的遺伝子を理解する上で重要な情報を与える。

snRNA Improvement of the multi-type analysis method of U2 伝子 (RNU2-1): When the number of polytypes of the remaining 伝子 (RNU2-1) is calculated, the number of the multi-type analysis method of the remaining 伝子 (RNU2-1) will be reduced to 10 or more.ため、リアルタイムPCR method によるComparative quantification キットでは correct results をIt is difficult ることはで、Quantitative quantification is absolutely necessary があった. In the 3rd year of Reiwa, the conditions for setting the conditions are set, and the normal people's bodies are analyzed and analyzed. The そのためReiwa 4-year PCR method was obtained by using the いる direction and でchange conditions and the healthy person's DNA. The Rika PCR method is used in the same situation and the results are the same, and the result is the same.ータの信頼性は高くデータGet にRequired するTime はShortened することができた. Collection of lung cancer patients' bodies is carried out by the Hospital Affiliated to the Faculty of Medicine.たが, バイオバンクより provides をReceived けるため新たに Ethics review application を行った. Quantification of snRNA fragments and analysis of the possibility of cross-reaction: データベースInformationによれば、miR-1246 (snRNA U2 fragment) の塩组arrayは小なくとも6 kinds of snRNA U2 pseudo remains 伝子に Save されている. This study focuses on the pseudo-U2 fragment (origin of RNU2-2P) and its homogeneous arrangement. The diseases that cause disease are beneficial to the patient. miR-1246 Analysis of isoform's serum: Analysis of the serum of patients with existing lung cancer and the increase of miR-1246 in the blood of patients with lung adenocarcinoma. miRBase typeではなく5' terminalが2塩baseshortいisoformのriseによるものであることを明らかにしreportした(Aiso T & Ueda M. Mol Med Rep 27:12979, 2023). The result is that the remaining target of miR-1246 is the target of understanding the important information and information on it.

项目成果

5' isomiR is the most abundant sequence of miR-1246, a candidate biomarker of lung cancer, in serum.

5 isomiR 是血清中 miR-1246（肺癌候选生物标志物）最丰富的序列。

• DOI: 10.3892/mmr.2023.12979
• 发表时间: 2023
• 期刊: Molecular Medicine Reports
• 影响因子: 3.4
• 作者: Aiso;T.;& Ueda;M.
• 通讯作者: M.

リアルタイムPCR法を用いた高コピー数多型の解析

使用实时 PCR 方法分析高拷贝数变异

• 发表时间: 2021
• 作者: 相磯聡子;上田真樹子
• 通讯作者: 上田真樹子