網羅的遺伝子・エピゲノム解析による性成熟疾患の病因の解明

通过综合遗传和表观基因组分析阐明性成熟疾病的病因

• 批准号: 20K08876
• 负责人: 鈴木 江莉奈
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: National Center for Child Health and Development
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K08876/
• 关键词: エピゲノム; NDNF遺伝子; DNAメチル化解析; エクソーム解析

本研究の目的は、性成熟疾患における新規発症責任遺伝子を同定することとエピゲノム状態の変化を明らかにすることである。本年度は、思春期遅発症患者を対象にDNAメチル化解析を行い、下記の成果を得た。思春期遅発症に関与するDNAメチル化変化を同定するため、既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者9例、健常成人男性8例と健常男児4例を対象に網羅的DNAメチル化アレイ解析を行った。得られたデータを用いてバイオインフォマティクス解析を行い、思春期遅発症男性患者と健常男性群との間でDNAメチル化レベルに有意な差を認める1,000以上のプローブを同定した。有意差を認める1,000以上のプローブの中から、つぎに挙げる2つの方法でメチル化異常を示すプローブを抽出した。第一に、ベン図解析を行い、患者間で重複して変化するプローブを抽出した。第二に、2,000 bp以内の領域で3つ以上のメチル化変化を示したプローブを含む領域をメチル化可変領域 (DMR)と定義し、DMR領域とDMR領域内に存在するプローブを抽出した。2つの独立した方法で抽出したプローブのDNAメチル化変化が思春期遅発症男性患者において存在するか否かを明らかにするため、解析対象数を増やしてパイロシーケンス法によるDNAメチル化解析を行った。既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者13例、原因不明思春期遅発症男性患者31例、健常成人男性50例を対象にパイロシークエンス法を用いてDNAメチル化率を算出した。一部の既知責任遺伝子バリアント陽性の思春期遅発症男性患者においてエピゲノム変化が存在するという結果を得ている。現在、得られた結果について論文投稿の準備を進めている。

Purpose の this study は, sexual maturity disorders に お け る new rules 発 disease responsibility heritage 伝 son を with fixed す る こ と と エ ピ ゲ ノ ム state の variations change を Ming ら か に す る こ と で あ る. In this year, the analysis of にDNAメチ and メチ resolution of を patients with 遅 onset of puberty was conducted on を and the results were を and た. Pubescent 遅 発 disease に masato and す る DNA メ チ ル change - change を with fixed す る た め, already know responsibility but 伝 バ リ ア ン ト positive の pubescent 遅 発 disease 9 cases of male patients, 8 healthy adult men often と healthy male where 4 cases often を like に snare DNA seaborne メ チ ル change ア レ イ parsing line を っ た. Have ら れ た デ ー タ を with い て バ イ オ イ ン フ ォ マ テ ィ ク ス parsing を い, pubescent 遅 発 disease と health often men among men with と の で between DNA メ チ ル change レ ベ ル に intentionally な poor を recognize め る above 1000 の プ ロ ー ブ を be し た. Significant difference を recognize め る above 1000 の プ ロ ー ブ の in か ら, つ ぎ に 挙 げ る 2 つ の way で メ チ ル mineralization anomaly を shown す プ ロ ー ブ を spare し た. First, に, ベ ベ graph analysis を row に, で repetition of <s:1> て variation among patients するプロ ブを ブを extraction of た た. で の field within the second に, 2000 bp more than 3 つ の メ チ ル change - change を shown し た プ ロ ー ブ を containing む field を メ チ ル (DMR) is changed to - field definition と し, DMR と に DMR field exist す る プ ロ ー ブ を spare し た. 2 つ の independent し た method で spare し た プ ロ ー ブ の DNA メ チ ル change - change が pubescent 遅 発 disease men に お い て exist す る か no か を Ming ら か に す る た め, parse image-number seaborne を raised や し て パ イ ロ シ ー ケ ン ス method に よ る DNA メ チ ル dissolve the analysis line を っ た. Responsibility but 伝 of children both バ リ ア ン ト positive の pubescent 遅 発 disease, including 13 cases of male patients, reason unknown pubescent 遅 発 disease of male patients with 31 cases, 50 cases of healthy adult men often を like に seaborne パ イ ロ シ ー ク エ ン を ス method with い て DNA メ チ ル flowrate を calculate し た. A の responsibility but 伝 of children both バ リ ア ン ト positive の pubescent 遅 発 disease men に お い て エ ピ ゲ ノ ム exist - turn が す る と い う results て を い る. Now, we have the られた result に に を て て て paper submission to prepare for を into めて る る る.

项目成果

生殖年齢の非閉塞性無精子症患者におけるモザイクY染色体喪失は稀である

育龄非梗阻性无精症患者的马赛克 Y 染色体丢失很少见

• 发表时间: 2021
• 作者: 鈴木 江莉奈;小堀 善友;勝見 桃理; 牛嶋 規久美;内山 徹;岡田 弘; 宮戸 真美;深見 真紀
• 通讯作者: 深見 真紀