Identification of genetic modifiers for the onset of Alexander disease

确定亚历山大病发病的遗传修饰因子

• 批准号: 20K16582
• 负责人: 安田 怜
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K16582/
• 关键词: アレキサンダー病; ゲノムワイド関連研究; 修飾因子; 遺伝的修飾因子; ゲノムワイド関連解析

【目的】アレキサンダー病はGFAP遺伝子変異による極めて希少な遺伝性神経変性疾患である。遺伝子変異から発症に至るメカニズムは不明であり、治療は対症療法にとどまっているため、病態の進行抑制、改善につながる治療法の開発が待たれている。本研究ではアレキサンダー病発症に関与する遺伝的修飾因子を同定することを目的とする。【方法】患者(症例群)と健常者(対照群)について、DNAマイクロアレイにより一塩基多型(SNP: single nucleotide polymorphism)データを取得し、ゲノムワイド関連研究(GWAS: genome-wide association study)を行う。【結果】DNAマイクロアレイ(Infinium Asian Screening Array)を用いて、アレキサンダー病79例、対照群738例のSNPデータを取得し、GWASによりアレキサンダー病発症とゲノムワイドレベルで有意に関連している2つの遺伝子座位を特定した。【考察】GWASで有意な関連を示した遺伝子座位はアレキサンダー病発症のメカニズムに関連している可能性がある。今後はエキソーム解析やターゲットリシーケンスにより、機能的バリアントの探索が必要である。発症に関与する遺伝子やバリアントが同定されれば、発症メカニズムの解明や、新規治療ターゲットの同定につながるものと考えられる。

【 Objective 】アレキサ, ダ, ダ, ダ diseases of GFAP leave 伝 genetic mutations による, めて, and very few な leave 伝 neurological disorders である. Heritage 伝 sub - different か ら 発 disease に to る メ カ ニ ズ ム は unknown で あ り, treatment は disease therapy seaborne に と ど ま っ て い る た め, pathological の suppressed, improve に つ な が る therapy の open 発 が stay た れ て い る. This study で は ア レ キ サ ン ダ 発 ー disease syndrome に masato and す る but 伝 modifier を with fixed す る こ と を purpose と す る. 【 method 】 patients cases (group) と health often (according to the group of seaborne) に つ い て, DNA マ イ ク ロ ア レ イ に よ り a salt Quito type (SNPS: single nucleotide polymorphism) デ ー タ を obtain し, ゲ ノ ム ワ イ ド masato research (GWAS: (genome-wide association study)を lines う. 【 Result 】DNA ロアレ (Infinium Asian Screening. Array) を い て, ア レ キ サ ン ダ ー disease in 79 cases, according to the group of 738 cases of seaborne の SNP デ ー タ を obtain し, GWAS に よ り ア レ キ サ ン ダ 発 ー disease syndrome と ゲ ノ ム ワ イ ド レ ベ ル で intentionally に masato even し て い る 2 つ の heritage 伝 child seat を specific し た. [investigation] GWAS で intentionally な masato even を shown し た heritage 伝 child seat は ア レ キ サ ン ダ 発 ー disease syndrome の メ カ ニ ズ ム に masato even し て い る possibility が あ る. Future は エ キ ソ ー ム parsing や タ ー ゲ ッ ト リ シ ー ケ ン ス に よ り, functional バ リ ア ン ト の explore が necessary で あ る. 発 disease に masato and す る heritage 伝 son や バ リ ア ン ト が with fixed さ れ れ ば, 発 メ カ ニ ズ ム の interpret や, new rules タ ー ゲ ッ ト の with fixed に つ な が る も の と exam え ら れ る.