Identification of genetic modifiers for the onset of Alexander disease

确定亚历山大病发病的遗传修饰因子

• 批准号: 20K16582
• 负责人: 安田 怜
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K16582/
• 关键词: アレキサンダー病; ゲノムワイド関連研究; 修飾因子; 遺伝的修飾因子; ゲノムワイド関連解析

【目的】アレキサンダー病はGFAP遺伝子変異による極めて希少な遺伝性神経変性疾患である。遺伝子変異から発症に至るメカニズムは不明であり、治療は対症療法にとどまっているため、病態の進行抑制、改善につながる治療法の開発が待たれている。本研究ではアレキサンダー病発症に関与する遺伝的修飾因子を同定することを目的とする。【方法】患者(症例群)と健常者(対照群)について、DNAマイクロアレイにより一塩基多型(SNP: single nucleotide polymorphism)データを取得し、ゲノムワイド関連研究(GWAS: genome-wide association study)を行う。【結果】DNAマイクロアレイ(Infinium Asian Screening Array)を用いて、アレキサンダー病79例、対照群738例のSNPデータを取得し、GWASによりアレキサンダー病発症とゲノムワイドレベルで有意に関連している2つの遺伝子座位を特定した。【考察】GWASで有意な関連を示した遺伝子座位はアレキサンダー病発症のメカニズムに関連している可能性がある。今後はエキソーム解析やターゲットリシーケンスにより、機能的バリアントの探索が必要である。発症に関与する遺伝子やバリアントが同定されれば、発症メカニズムの解明や、新規治療ターゲットの同定につながるものと考えられる。

目的：亚历山大病是由GFAP基因突变引起的一种极为罕见的遗传神经退行性疾病。导致遗传突变开始的机制尚不清楚，并且治疗仅限于有症状的治疗，因此人们很高的希望，希望有助于抑制和改善疾病状态的治疗方法的发展。这项研究旨在确定与亚历山大氏病发展有关的遗传修饰剂。 [方法]使用DNA微阵列（病例组）和健康受试者（对照组）以及全基因组关联研究（GWAS）获得单核苷酸多态性（SNP）数据。 GWAS确定了79种亚历山大氏病和738个对照组的SNP数据，使用DNA微阵列（Infinium Asian筛查阵列）获得了与Alexander氏病在全基因组范围内显着相关的两个基因座。 [讨论]与GWAS显着相关的基因座可能与亚历山大疾病发展的机制有关。将来，有必要通过外显子分析和目标重新方程来搜索功能变体。人们认为，如果确定了涉及的基因和变体，它将导致阐明发作机制和新治疗靶标的鉴定。