Search for specific genes involved in invasion of early gastric cancer using laser microdissection

利用激光显微切割寻找参与早期胃癌侵袭的特定基因

• 批准号: 20K16959
• 负责人: 谷内田 達夫
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Kagawa University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K16959/
• 关键词: レーザーキャプチャーマイクロダイセクション法; 早期胃癌; ESD

本研究の目的はLCM法を用いて早期胃癌の粘膜内癌部、SM浸潤部と非癌部を組織採取し、より精度の高いDNAを抽出し、次世代シーケンサでCancer Hotspot Panelを用い、KRAS、BRAF、EGFR、TP53 など50 種のがん遺伝子、がん抑制遺伝子のホットスポット約2800 の変異をカバーしており浸潤部での特徴的な遺伝子変異の同定し、診断マーカー、予後判定としての有用性や治療分子としての可能性を明らかにすることを目的とする。香川大学医学部附属病院において、内視鏡的粘膜下層剥離術（ESD）にて治療された浸潤度別の早期胃癌のESD腫瘍組織検体で、10例の収集を目標としている。これまでのところ5例収集し、随時当院病理で作成されたFFPE組織ブロックをミクロトームで10μmの厚さの切片を作成。レーザーキャプチャーマイクロダイセクション(LCM)法で顕微鏡観察下で切片上の任意部位をレーザーで切り回収を行っている。顕微鏡観察で切片内の非癌部、粘膜内癌部、下層深部浸潤部の各々から切り分け、H.E.染色と未染色の切片を作成し、H.E.染色で癌部を同定し、未染色切片で作成したスライドガラスにてレーザーで十分量の組織を回収。回収したサンプルから、DNAを抽出している。

The purpose of this study is to use LCM method to extract DNA from the intramucosal cancer, SM invasive and non-cancerous parts of early gastric Cancer with high precision, to use the next generation Cancer Hotspot Panel, KRAS, BRAF, EGFR, TP53, 50 kinds of genes, about 2800 kinds To determine the usefulness of the therapeutic molecule, the possibility of the treatment, and the purpose of the treatment. Endoscopic submucosal dissection (ESD) was performed at Kagawa University Hospital. The tumor tissue samples of ESD with different degrees of invasion were collected in 10 cases. 5 samples were collected and prepared at any time. FFPE tissue sections were prepared at a thickness of 10μm. The LCM method is used to examine any part of the slice. Microscopic examination of non-cancerous sections, intramucosal cancerous sections, and deep underlying infiltrative sections; H.E. staining; preparation of unstained sections; determination of H.E. stained cancerous sections; preparation of unstained sections; and retrieval of ten percent of tissues. The DNA was extracted.