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神経線維腫症2型(NF2)における遺伝子診断法の確立

2型神经纤维瘤病（NF2）基因诊断方法的建立

基本信息

批准号：
20K17954
负责人：
寺西裕
金额：
$ 2.66万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K17954/
关键词：
神経線維腫症2型 Neurofibromatosis type 2 NF2遺伝子神経鞘腫体細胞モザイク Long read sequence 生殖細胞変異 Schwanomatosis 遺伝子診断 Whole genome sequence 神経線線維腫症２型

项目摘要

神経線維腫症2型(Neurofibromatosis type 2:NF2)はNF2 germline mutationにより脳腫瘍が多発し、根治治療法が無い遺伝性疾患である。実臨床ではNF2と臨床診断されるが、NF2 germline mutationが検出されない患者が5割存在することが知られている。現在の診断基準は臨床診断であり、遺伝子診断は確立されていない。本研究の目的はNF2患者におけるNF2遺伝子変異を正確に検出する方法を明らかにし、NF2の遺伝子診断法を確立することである。Discovery study: Intron variantの検出:施行期間: 2020年4月~2021月9月対象:これまでの解析でNF2と診断されるにも関わらずNF2 germline mutationが検出されず、かつ体細胞モザイクでもない患者の末梢血DNA計10検体を当初予定していた。しかし疾患責任遺伝子及びvariantだけでなく、修飾因子の存在も示唆される報告があったため、対象をNF2患者72例とした。またシークエンスに関しては当初whole genome sequenceを行う予定であったが、intron variantやnon-coding lesionを対象としたsequenceが必要であること、また過去の報告ではNF2遺伝子及びschwannomatosisに関わるLZTR1, SMARCB1遺伝子以外に疾患発生に関わる遺伝子は発見されていないことから、この3遺伝子の全ゲノム領域に対するPac Bio sequel/sequel2を用いたlong read sequenceを行う方針となった。現在24検体分までのシークエンスが終了、残りの４８検体はprobe captureを行なっている段階である。

Neurofibromatosis type 2:NF-2 germline mutation is a common cause of neurofibromatosis. The NF2 germline mutation was detected in 5 patients and was detected in 5 patients. The diagnostic criteria are now established for clinical diagnosis and genetic diagnosis. The aim of this study was to clarify the methods for correctly detecting NF2 gene variants in NF2 patients and to establish the methods for diagnosing NF2 gene variants. Discovery study: Detection of Intron variant: Implementation period: April 2020 ~ September 2021 Target: Analysis of NF2 and diagnosis of NF2 germline mutation was detected, somatic cells were detected, and peripheral blood DNA count of patients was initially determined. 72 cases of NF2 patients were reported with the presence of disease responsible genes and variants. In the past, NF2 genes and schwanatomosis were reported in relation to LZTR1, SMARCB1 genes, and disease development was reported in relation to disease development. The Pac Bio sequence/sequel2 is used in the long read sequence of the three sequences. Now the 24-mode probe capture process is over, and the 48-mode probe capture process is over.

项目成果

期刊论文数量（12）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

網羅的遺伝子解析によって明らかになった神経線維腫症2型(NF2)の多様な臨床的・遺伝的背景

综合遗传分析揭示 2 型神经纤维瘤病 (NF2) 的不同临床和遗传背景

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
寺西裕;宮脇哲;小原健太;本郷博貴;堂福翔吾;高柳俊作;中冨浩文;齊藤延人
通讯作者：
齊藤延人

Characteristics of Mosaic Neurofibromatosis type 2 Revealed by Deep Sequence for Multiple Tissue DNA

多组织 DNA 深度序列揭示 2 型马赛克神经纤维瘤病的特征

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yu Teranishi;Satoru Miyawaki;Hiroki Hongo;Shogo Dofuku;Atsushi Okano;Shunsaku Takayanagi;Takahiro Ota;Jun Yoshimura;Wei Qu;Jun Mitsui;Hirofumi Nakatomi;Shinichi Morishita;Shoji Tsuji;Nobuhito Saito
通讯作者：
Nobuhito Saito

神経線維腫症2型における初発症状とNF2遺伝子変異型との関連解析

2型神经纤维瘤病初始症状与NF2基因变异的关联分析