Escherichia albertiiの食肉汚染と病原性発現機構に関する研究

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昨年度実施した豚生体サンプル由来DNAを供試した試験では、口腔スワブを含む生体試料や水飲み場のスワブを含む環境試料からEscherichia albertiiが検出された。そのため、R4年度は、さまざまな部位由来の市販豚内臓肉について、E. albertiiの汚染実態調査を実施した。その結果、複数の小売店で販売されていたレバーやホルモンなどからE. albertiiの遺伝子が検出され、その中のホルモンやタンから本菌が分離された。また、E. albertiiの病原因子の解析では、astA（腸管凝集付着性大腸菌耐熱性エンテロトキシン1をコードする遺伝子）について解析した。astAは、特に大腸菌において保有が確認されており、令和2年にはastA保有大腸菌を原因とする患者数2,958名の大規模な事例も報告され、注目された。astAは、細菌の染色体またはプラスミドにコードされており、配列の多様性（バリアント）が報告されている。これまでE. albertiiのastA保有についての詳細な報告がなかったため、過去に収集した集団食中毒事例由来株などのヒト由来株、動物由来株および食品由来株について解析した。その結果、供試した57株中散発下痢症由来の1株がastA特異的コンベンショナルPCR法陽性であった。遺伝子シーケンスによって配列を特定したところ、配列が不完全であり、astAとしては機能していないことが予想された。そのため、今回調査した株に関しては、E. albertiiの病原性にastAは重要ではないことが示唆された。さらに、集団食中毒事例由来株、散発下痢症由来株および食品由来株の一部について全ゲノム配列取得用のライブラリーを調製し、Illumina MiniSeqを用いて配列を取得した。当初はシーケンサーの稼働は外注する予定であったが、共通機器としてMiniSeqが整備されたため、その装置を活用した。