ネオロコモ:俯瞰的システムから挑む運動器不全メカニズムの全貌解明
ネオロコモ:俯瞰的システムから挑む運動器不全メカニズムの全貌解明
批准号:
20K20657
负责人:
松井 佑介
金额:
$4.08万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-07-30 至 2024-03-31
中文摘要
本年度は、主に前年度に開発した解析パイプラインのソフトウェア公開および論文化を中心に進めた。一つ目は、非統制環境下においてビデオベースモーションキャプチャ手法の一つであるOpenPoseにより測定された歩行データに対する自動前処理方法の開発である。ソフトウェアを公開し、計算生物学の国際雑誌に掲載された。二つ目は、集団レベルにおける筋シナジー解析パイプラインの開発である。従来の筋シナジー解析アルゴリズムは1個人を念頭においており、個々に推定した複数人の筋シナジーを比較する場合には、アドホックな処理を通じて対応する必要があった。そこで、多人数の多チャンネル筋電図を想定した場合の筋シナジー母平均の推定精度について、統計的検証を実データとシミュレーションを駆使して徹底して行った。その結果、従来のアドホックな方法では、母平均推定において深刻なバイアスが生じることが明らかとなった。また、ノイズに対しても脆弱であった。そこで、我々は漸近性を有し、ノイズロバストな集団レベル筋シナジー解析アルゴリズムを開発した。これにより集団間の筋シナジー比較をするような、集団ベースの研究において、統計的バイアスを大幅に軽減しかつノイズロバストな解析が可能となった。本手法についても論文を完成させ、現在投稿中である。
英文摘要
本年度は、主に前年度に開発した解析パイプラインのソフトウェア公開および論文化を中心に進めた。一つ目は、非統制環境下においてビデオベースモーションキャプチャ手法の一つであるOpenPoseにより測定された歩行データに対する自動前処理方法の開発である。ソフトウェアを公開し、計算生物学の国際雑誌に掲載された。二つ目は、集団レベルにおける筋シナジー解析パイプラインの開発である。従来の筋シナジー解析アルゴリズムは1個人を念頭においており、個々に推定した複数人の筋シナジーを比較する場合には、アドホックな処理を通じて対応する必要があった。そこで、多人数の多チャンネル筋電図を想定した場合の筋シナジー母平均の推定精度について、統計的検証を実データとシミュレーションを駆使して徹底して行った。その結果、従来のアドホックな方法では、母平均推定において深刻なバイアスが生じることが明らかとなった。また、ノイズに対しても脆弱であった。そこで、我々は漸近性を有し、ノイズロバストな集団レベル筋シナジー解析アルゴリズムを開発した。これにより集団間の筋シナジー比較をするような、集団ベースの研究において、統計的バイアスを大幅に軽減しかつノイズロバストな解析が可能となった。本手法についても論文を完成させ、現在投稿中である。
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変形性関節症をドライブする 『老化× メカニカルストレス』分子制御の探求―メタアナリシスとシステム生物学による統合的アプローチ―
探索导致骨关节炎的“衰老 x 机械应力”的分子控制 - 使用荟萃分析和系统生物学的综合方法 -
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
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作者:
[辻田那月, 片岡茉好, 船曳康子, 飯島弘貴;松井 佑介]
通讯作者:
飯島弘貴;松井 佑介
多群比較のための固定NMFによる筋シナジー変動解析手法の提案
提出使用固定NMF进行多组比较的肌肉协同变异分析方法
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[宇野光平, 松井佑介, 野嶌一平]
通讯作者:
野嶌一平
骨格筋特異的な分子ネットワークに基づく遺伝子モジュールの同定および各運動様式に対する分子応答の推定
基于骨骼肌特异性分子网络的基因模块识别以及对每种运动模式的分子反应的估计
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shuji Mori, Willy Wong, 兒玉隼汰;飯島弘貴;宇野光平;松井佑介]
通讯作者:
兒玉隼汰;飯島弘貴;宇野光平;松井佑介
個々のゲノム情報を考慮した変異ペプチドに基づく異常タンパク質の同定方法とアルツハイマー病への応用
考虑个体基因组信息的基于突变肽的异常蛋白识别方法及其在阿尔茨海默病中的应用
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[都築凛華, 宇野光平, 松井佑介]
通讯作者:
松井佑介
アルツハイマー病の潜在的病態進行度を推定するための機械学習アプローチの検討
检查机器学习方法来估计阿尔茨海默病的潜在进展
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[林勇作, 宇野光平, 松井佑介]
通讯作者:
松井佑介
共 18 条
リバーストランスオミクス解析によるがんシステムのボトムアップ統合理解と攻略
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批准号:23K20389
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2024
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负责人:松井 佑介
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依托单位:
トランスフィジオーム:脳筋連関ネットワークから挑む運動機能可塑性の俯瞰的理解
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批准号:23K18505
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:松井 佑介
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依托单位:
Reverse Trans-Omics Analysis for Comprehensive Bottom-up Understanding Toward Conquering Cancer Systems
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批准号:20H04282
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$10.98万
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财政年份:2020
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负责人:松井 佑介
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依托单位:
海外基金