Breeding a rice line for cold stress escape that has ability to shift flowering by water management

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本研究では、Nested association mapping population (NAM)集団を解析材料に用いた。通常は、注目形質に関わるQTLを同定する際、2品種間のF2やRecombinant inbred lines (RILs、組換え自殖系統群）を材料とした解析が主流である。しかし、親品種の遺伝的背景によっては目的のQTLを検出できない場合も少なくない。一方、近年の技術進歩によりDNA変異をゲノムワイドに調べることが容易になり、多くの品種を対象に注目形質QTLを検出することが可能になった。しかし、イネでは潜在的な集団構造の特徴により偽陽性等が生じやすく、その成功例は限られている。これに関して、この問題はNAM集団、即ち複数の既存品種と一つの共通親との交雑から得られた複数組み合わせのRILsを解析に用いることで回避できると期待される。そこで本研究では、7組合せのRILsからなるNAM集団（計約1000系統）を用い、圃場条件下にて異なる土壌水分環境下にて栽培し、次年度の解析に必要な出穂期データを取得した。最終的に、異なる水管理により誘導される出穂遅延遺伝子座を計10個以上検出することに成功した。次に、これらがこれらが組み合わさることで得られる影響を解析した結果、より大きく出穂期を変動できることを見出した。このことは、これらの遺伝子座を効果的に組み合わせることにより、異なる水管理を通して出穂期を調節しうること、ならびに本手法により冷害回避を可能にする品種育成の可能性を示すものであり、今後の展開が大いに期待できる。