新規に開発したBLLナノ構造体による、タンパク質結晶核形成過程の研究
新規に開発したBLLナノ構造体による、タンパク質結晶核形成過程の研究
批准号:
21H01754
负责人:
姚 閔
金额:
$11.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
タンパク質の結晶核形成は、低頻度で制御困難な、タンパク質溶液-結晶相転移過程を経て進む。その核形成過程は、タンパク質分子の形態学上の複雑性(多様なサイズ、不規則な形状、様々な表面電荷、表面形状の動的な特徴など)に依存する。そのためタンパク質の結晶化は、結晶構造解析技術が非常に速い勢いで発展している現在においても、依然として,越えなければならない大きな壁として立ちはだかっている。本研究では、我々が開発したBLLナノ構造を持つ核剤がタンパク質分子の配列規則性を誘発し、分子の自己組織化・結晶性パッキングを引き起こす過程(溶液-結晶相転移過程)を促進するメカニズムを解明する。核剤の設計に理論的な基盤を提供することで、より汎用性のある、有効なタンパク質結晶化の核剤の設計・創製を可能にし、溶液-結晶相転移の制御を実現することを目指す。本研究の目的を達成するため、2021年度では、1.促進メカニズムについて、既に開発していた、効果のあるBLL核剤2種類を熱処理や、超音波処理によって人工的に表面レッジを作り、TEMで確認したところで、形状を良く保っている1種類の核剤を使用することにした。その核剤を用いて標準タンパク質を結晶化した。その結果、核剤は結晶化溶液過飽和相(核形成領域)を変化させることを見出した。2.BLL核剤の汎用性について、1で選んだBLL核剤を当研究室に行われた結晶化に問題があるタンパク質Mps3(NTD)、AOD、SelU-tRNAなどへ適用するため、それらのサンプルの大量発現・精製などの調製を行った。BLL核剤を加えて、結晶化を試みた。そのうち、Mps3(NTD)とAODの初期結晶を得た。また、BLL核剤の使用方法の検討も行って、結晶化プレートへコーデング、タンパク質溶液との混合のときに、BLLの濃度と効果を検討した結果、最適条件を見つけた。
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Synthesis of MOF nucleant with nanostructure via solution-phase self-assembly
通过溶液相自组装合成具有纳米结构的MOF成核剂
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yu Fukushima, Naruo Sasaki, Long Li・Xiao-mei Sun・Min Yao]
通讯作者:
Long Li・Xiao-mei Sun・Min Yao
鉄硫黄クラスターを持つ酵素が触媒するtRNA硫黄修飾の反応機構
铁硫簇酶催化tRNA硫修饰反应机理
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[石坂優人, 陳明皓, 奈良井峻, 堀谷正樹, 田中良和, 于健, 姚閔]
通讯作者:
姚閔
DOI:
10.1016/b978-0-12-821888-4.00017-4
发表时间:
2021
期刊:
Biomass, Biofuels, Biochemicals
影响因子:
--
作者:
[Niveditha Kulangara;S. Sukumaran]
通讯作者:
Niveditha Kulangara;S. Sukumaran
新たな蛋白質結晶化促進剤の開発と応用
新型蛋白质结晶促进剂的开发及应用
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yasuda Satoshi, Matsushima Hisayoshi, Harada Kenji, Tanii Risako, Terasawa Tomo-o, Yano Masahiro, Asaoka Hidehito, Gueriba Jessiel Siaron, Dino Wilson Agerico, Fukutani Katsuyuki, 姚閔]
通讯作者:
姚閔
Alfafold2を用いた構造未知酵素-tRNA複合体の位相決定
使用 Alfafold2 对未知结构的酶-tRNA 复合物进行相测定
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[介川 裕章, シャイケ トーマス, 温 振超, 葛西 伸哉, 三谷 誠司, Yuta Takano, 志村泰充,西村京輔,北川拓也,稲垣怜史,窪田好浩, 俵 毅彦,平石 真也,稲葉 智宏,徐 学俊,太田 竜一,足立 智,尾身 博雄, 佐々木成朗, 吉田 和矢,Vasudevan Pillai Biju,髙野 勇太, 碓井 拓哉・大江 花・尾瀬 農之・姚 閔]
通讯作者:
碓井 拓哉・大江 花・尾瀬 農之・姚 閔
共 13 条
分子量が1億ダルトンに及ぶ生体超分子の構造解析を可能とするソフトウェアの開発
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批准号:20051001
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.74万
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财政年份:2008
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负责人:姚 閔
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依托单位:
情報工学・遺伝子工学・結晶工学の融合による蛋白質新規結晶化法
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批准号:20657021
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2008
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负责人:姚 閔
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依托单位:
分子量1億ダルトンに及ぶ生体超分子の構造解析を可能とするソフトウェアの開発
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批准号:18054001
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.9万
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财政年份:2006
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负责人:姚 閔
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依托单位:
分子量が1億ダルトンに及ぶ生体超分子の構造解析を可能とするソフトウェアの開発
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批准号:17053001
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2005
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负责人:姚 閔
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依托单位:
海外基金