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Elucidation of the cooperative DNA recognition mechanism of transcription factors in brassinosteroid-responsive gene regulation

Elucidation of the cooperative DNA recognition mechanism of transcription factors in brassinosteroid-responsive gene regulation
阐明油菜素类固醇响应基因调控中转录因子的协同DNA识别机制
批准号:
21H02114
负责人:
宮川 拓也
金额:
$11.15万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

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项目成果

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ブラシノステロイド(BR)は植物の多岐にわたる成長過程を総じて促進的に調節する植物ホルモンである。BRの生理作用に必要な遺伝子セットの発現調節を担うマスター転写因子BIL1/BZR1がBR応答性遺伝子のプロモーター上の塩基配列に結合し、その転写を制御する分子実態はまだ十分に理解されていない。本研究により、BIL1/BZR1のDAP-seqデータとDNAマイクロアレイデータの統合解析に基づき、BIL1/BZR1が単独で結合可能なNN-BRRE-core配列をプロモーター上にもつ遺伝子は転写が抑制され、この配列への親和性がさらに外側の核酸塩基の種類に大きく影響を受けることが示された。そこで本年度は、この外側の核酸塩基の影響を定量的に評価した。さらに、BIL1/BZR1と各種DNAとの複合体構造から、NN-BRRE-core配列に対する結合親和性の調節に必要なDNAの形状読み取り機構に寄与するアミノ酸残基を検討し、プロトプラストを用いた一過性発現レポーターアッセイ等により、DNA主鎖リン酸基との相互作用ネットワーク形成に関わる2つのアミノ酸残基がこの機構において重要であることを特定した。以上の成果より、BIL1/BZR1による直接的なBR応答遺伝子の発現誘導では、BIL1/BZR1単独での比較的弱い結合、延いては他の転写因子や共役因子との協働等によりBIL1/BZR1をプロモーター上に誘引する仕組みが存在する可能性が考察された。本研究ではまた、BIL1/BZR1と他の転写因子のDAP-seqデータから選定した複数の転写因子に着目し、酵母ツーハイブリッド法等による相互作用解析を行い、BIL1/BZR1と相互作用する複数の転写因子が見出された。
期刊论文(7)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
ブラシノステロイド応答性の遺伝子抑制にはマスター転写因子のDNA形状認識が必須である
主转录因子的 DNA 形状识别对于油菜素类固醇反应性基因抑制至关重要
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [野﨑翔平, 光田展隆, 坂本真吾, 山上あゆみ, 徐玉群, Bui Thi Bao Chau, 寺田透, 三浦謙治, 中野雄司, 田之倉優, 宮川拓也]
通讯作者: 宮川拓也
DOI: 10.1038/s41477-022-01289-6
发表时间: 2022-12-15
期刊: NATURE PLANTS
影响因子: 18
作者: [Nosaki, Shohei, Mitsuda, Nobutaka, Miyakawa, Takuya]
通讯作者: Miyakawa, Takuya
DOI: 10.1093/plcell/koab151
发表时间: 2021-06-01
期刊: PLANT CELL
影响因子: 11.6
作者: [Furuya, Tomoyuki, Saito, Masato, Kondo, Yuki]
通讯作者: Kondo, Yuki
ブラシノステロイド情報伝達の構造生物学と多階層アプローチへの展望
油菜素类固醇信号传导的结构生物学和多层次方法的前景
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [Lingxiao Yu, Takuya Katayama, Tatsuyuki Katagai, Reiko Shinkura, Jun-ichi Maruyama, 三浦 夏子, 宮川拓也]
通讯作者: 宮川拓也
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