Genetic analysis of species-specific haplotype diversification causing rice reproductive isolation.

导致水稻生殖隔离的物种特异性单倍型多样化的遗传分析。

• 批准号: 21H02168
• 负责人: 山形 悦透
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02168/
• 关键词: 雑種不稔; ハプロタイプ; 分化進化; イネ; Oryza属AAゲノム種

(研究3) O. meridionalis/ O. nivara交雑後代において、S21ヘテロ接合体でも遺伝性の稔性復帰個体が観察されるため、相互作用遺伝子座S21-interacting gene (SIG)を想定し、後代検定等を進めたが同定には至らなかった。遺伝様式を検討した結果、キメリックにエピジェネティックな表現型復帰(エピ表現型復帰)が起き、その変化は後代に継承される、と推察した。このエピジェネティック制御の仮説を新たに提案し、以後の研究を展開した。(研究1-2) RNA-seq：S21-mer, S21-nivに注力して実験を行った。計画通り遺伝子型に基づき、RNA-seq用の試料は採取した。しかしながら前述のとおりエピジェネティックな表現型復帰がキメリックに起こるため、分げつ/穎花ごとの表現型の運命は花粉発育期では観察者に対して未確定であるため、RNA-seq用に採取した葯の表現型が必ずしも想定したものではない可能性が考えられた。そのため、解読は一時的に見合わせている。分げつごとに花粉稔性と原因遺伝子座周辺のDNAメチル化領域を同定したのち、DNAメチル化程度に基づいてRNA-seqを行う計画とした。そのため、分げつごとにバイサルファイトシーケンスのライブラリー作成を行い、解読に着手した。 (2-2)ORF2のRIP活性の変異: キラー型のO. sativaアレルと、非キラー型のO. merdionalis、O. nivaraアレル由来コンストラクトに関して、大腸菌発現コンストラクトを作成した。リボソーム不活性化活性を有するOsRIP1のHisタグ精製タンパク質を得た。麦芽由来の無細胞翻訳系を用いてOsRIP1を用いたリボソーム不活性化の検出系の実験条件の検討を行っている。遺伝子発現については研究１，タンパク質の活性については研究2にて検討を引き続き行う。

（研究3）在O. Meridionalis/O中。 Nivara杂交后代，遗传恢复个体也在S21杂合子中观察到，因此，假设相互作用基因座S21相互作用基因（SIG）进行了后代测试，但无法实现鉴定。在检查了遗传模式之后，我们估计表观遗传表型回归（表观型回复）发生在嵌合中，并且这些变化是后来遗传的。提出了表观遗传控制的这一假设，并开发了随后的研究。 （研究1-2）进行了实验，重点是RNA-seq：S21-MER和S21-NIV。按计划根据基因型收集RNA-Seq的样品。然而，如上所述，表观遗传表型逆转发生在嵌合发生，并且由于在花粉发育期间未确定每个分er/肽的表型的命运尚不确定与观察者，因此不必假设收集的RNA-SeqQ的Anther的表型。因此，解密是暂时暂停的。在为每个分erer鉴定出因子基因座周围的花粉生育能力和DNA甲基化区域后，根据DNA甲基化程度计划了RNA-Seq。因此，我们为每个分erer创建了一个Bisulfite序列的库，并开始对其进行解密。 （2-2）为ORF2：大肠杆菌表达构建体中的RIP活性突变是为杀手O. sativa等位基因和非杀手O. Merdionalis，O。Nivara等位基因衍生的构建体的。获得了具有核糖体灭活活性的OSRIP1的HIS标记纯化蛋白质。我们正在研究使用从麦芽衍生的无细胞翻译系统使用OSRIP1检测核糖体失活的实验条件。该研究将继续在研究1中进行基因表达，并将在研究2中审查蛋白质的活性。

项目成果

Oryza sativaとO. glumaepatula間の種間雑種において見出された染色体11に座乗するGamete eliminator

配子消除器位于水稻和 O. glumaepatula 的种间杂交中，位于 11 号染色体上

• 发表时间: 2022
• 作者: Okamoto;T.;Wei;X.;Mehraj;H.;Rashed Hossain;M.;Akter;A.;Miyaji;N.;Takada;Y.;Park;J.-I.;Fujimoto;R.;Nou;I.-S.;and Watanabe;M.;河田 倫典・安井 秀・山形 悦透
• 通讯作者: 河田 倫典・安井 秀・山形 悦透

イネ属AAゲノム種におけるF1花粉不稔遺伝子S21の分化に関する遺伝解析

稻属AA基因组种F1花粉不育基因S21分化的遗传分析

• 发表时间: 2023
• 作者: 金あおい;高田美信;清水元樹;高山誠司;鈴木剛;小林恭士;渡辺正夫;村上亮・阪田光和・安井秀・山形悦透
• 通讯作者: 村上亮・阪田光和・安井秀・山形悦透

野生イネをFounder系統とする連続戻し交雑Nested Association Mapping集団を用いたF?花粉不稔の遺伝解析

以野生稻为始祖系的连续回交巢式关联作图群体对 F? 花粉不育性的遗传分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 高橋祐人;名嘉真良広;松下純平;原田昌彦;梅原彩・安井秀・山形悦透
• 通讯作者: 梅原彩・安井秀・山形悦透

染色体5 に検出されたF1花粉不稔関連QTLにおけるOryza glumaepatula種内の変異

在 5 号染色体上检测到 F1 花粉不育相关 QTL 的稻品种内变异

• 发表时间: 2021
• 作者: 髙塚歩;風間智彦;鳥山欽哉;河田 倫典・安井 秀・山形 悦透
• 通讯作者: 河田 倫典・安井 秀・山形 悦透

Oryza sativa L.とO. glumaepatula Steud.間の種間交雑において花粉不稔と種子不稔を引き起こすQTL qSG11の同定

水稻和 O. glumaepatula Steud 种间杂交中引起花粉不育和种子不育的 QTL qSG11 的鉴定。

• 发表时间: 2022
• 作者: 上野佑也;山崎祥他;保科宏道;原田昌彦;河田倫典・安井秀・山形悦透
• 通讯作者: 河田倫典・安井秀・山形悦透