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Assessing future climate risks for 11 major tree species using spatial modeling of adaptive genetic variations

Assessing future climate risks for 11 major tree species using spatial modeling of adaptive genetic variations
使用适应性遗传变异的空间模型评估 11 种主要树种的未来气候风险
批准号:
21H02240
负责人:
内山 憲太郎
金额:
$11.15万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31

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本研究は、気候変動が日本の主要な高木種11種に与える影響をゲノム内の適応度遺伝成分と気候情報の空間モデリングを通して明らかにすることを目的とする。研究対象種のうち、本年度はミズナラ天然林33集団524個体、アラカシ天然林22集団350個体、モミ天然林19集団295個体について、ddRAD-seqにより、ゲノムワイドなDNA多型情報を取得した。これにより計画していた11種のうち9種についてゲノムワイドなDNA多型情報の取得が終了した。検出されたSNP数は樹種により幅があるが、クオリティフィルタリング実施後の数値で、スギ31676座、ヒノキ8500座、ブナ4329座、ミズナラ27973座、アラカシ33815座、モミ6837座となった。スダジイ、ツブラジイ、タカネザクラはシーケンスは終わっており、現在多型検出中である。スギとブナについて、DNA多型情報と過去の生物気候変数(bioclimatic variables, World Clim v2)との関連解析を行い、気候環境への適応が予想される遺伝子(適応候補遺伝子セット)を抽出した。そのうちのスギについて、Gradient Forestモデルを用いて、適応候補遺伝子セットと生物気候変数との空間モデリングを行い、適応度遺伝成分の空間分布を明らかにした。その結果、スギでは太平洋側の端および日本海側の全域で適応遺伝成分が大きく変化し、スギではこれらの地域において自然選択が強く働いている可能性が示された。この作成したモデルを用いて、複数のCO2排出シナリオに基づいた将来気候条件下で、適応度遺伝成分がどのように攪乱されるかをgenetic offset(遺伝的脆弱性)として評価した。その結果、九州、四国の一部内陸域および東北地方の一部地域においてgenetic offsetが上昇することが予測された。
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
スギの適応遺伝変異の空間分布と気候変動への応答可能性評価
日本柳杉适应性遗传变异的空间分布及气候变化响应潜力评估
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [内山憲太郎(森林総合研究所), 中尾勝洋(森林総合研究所関西支所), 津村義彦(筑波大学)]
通讯作者: 津村義彦(筑波大学)
産地試験地を用いたスギの環境適応遺伝子の検出
利用当地试验点检测日本柳杉的环境适应基因
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [内山憲太郎, 韓慶民, 楠本倫久, 中尾勝洋, 金谷整一, 上野真義(森林総合研究所), 陶山佳久(東北大学), 津村義彦(筑波大学)]
通讯作者: 津村義彦(筑波大学)
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [伊原徳子, 内山憲太郎, 金谷整一(森林総合研究所), 陶山佳久(東北大学大学院農学研究科), 津村義彦(筑波大学生命環境系)]
通讯作者: 津村義彦(筑波大学生命環境系)
温暖化後にスギ林業は成立するか? 全ゲノム情報から予測する温暖化後のスギ林の応答
  • 批准号:
    24H00527
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $30.53万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    内山 憲太郎
  • 依托单位: