DNAメチル化を基盤としたヒト心筋細胞発生分化機構の制御に関する研究

基于DNA甲基化调控人心肌细胞发育分化机制的研究

基本信息

  • 批准号:
    21H02381
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.23万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究の目的は、心筋細胞分化の阻害となるヒトiPS細胞内分子ネットワークの同定とその制御を通して、心筋発生分化の理解の深化を目指すことである。ヒト心筋発生を研究する上でiPS細胞は有用なツールであるが、一方でヒトiPS細胞は変化を受けやすい特性を持ち、同一細胞株にもかかわらず異なる施設間で特性が変化する事例は多く報告されている。それ故ヒトiPS細胞の分化指向性を解析し、その制御に関する研究は重要な課題である。心筋細胞への分化効率の異なるiPS細胞株を多数解析し、心筋細胞分化効率に影響を及ぼす分子ネットワークを同定することは、多分化能の維持機構のみならず、心筋発生の分子機序を解明することになる。本研究では、多数の未分化ヒトiPS細胞から得られる網羅的DNAメチル化データ、遺伝子発現データとAI技術の一つである機械学習を組み合わせ、未分化状態のヒiPS細胞のデータから心筋細胞への分化効率を予測する学習モデルを構築し、さらに学習モデルの要素解析から心筋細胞分化の阻害となるヒトiPS細胞内分子ネットワークの同定と多分化能の維持機構の解析を進めている。本研究を遂行するためには、クオリティーの高い良質な網羅的データを取得することが重要であり、昨年度までに未分化状態時のヒトiPS細胞35株から網羅的DNAメチル化情報の取得が完了した。さらに同一サンブルにおける心筋細胞分化誘導を行い、各株の分化効率実測値データの取得を行った。これらのデータを基に心筋細胞分化の阻害となるヒトiPS細胞内分子ネットワークの同定と多分化能の維持機構の解析が進行中である。
The aim of this study was to clarify the regulation and regulation of the regulation of intracellular molecular processes in iPS cells and to deepen the understanding of cardiac differentiation. In the study of cardiac muscle development, iPS cells have been reported to have different characteristics in different cell lines. Therefore, it is an important task to analyze the differentiation orientation of iPS cells and to study the regulation of iPS cells. Analysis of iPS cell lines with different differentiation rates, effects of differentiation rates on cardiac muscle cells, and identification of molecular mechanisms for maintaining differentiation rates, and elucidation of molecular mechanisms for cardiac muscle development In this study, most of the undifferentiated iPS cells were isolated from the collected DNA, DNA The analysis of factors in the study of cell differentiation, inhibition of cell differentiation and maintenance of cell differentiation in iPS cells This study was carried out to obtain high-quality DNA information from 35 iPS cells in the undifferentiated state. In addition, the differentiation rate of each plant was measured and the differentiation rate was obtained. The analysis of the mechanism for the maintenance of cellular differentiation and differentiation is under way.

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
ヒトiPS細胞の神経分化指向性を予測するエピゲノムマーカーの同
鉴定预测人类 iPS 细胞神经元分化倾向的表观基因组标记
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    関谷 麻杜・高澤 建・新井 良和・堀家 慎一・阿久津 英憲・梅澤 明弘・西野 光一郎
  • 通讯作者:
    関谷 麻杜・高澤 建・新井 良和・堀家 慎一・阿久津 英憲・梅澤 明弘・西野 光一郎
エピゲノム情報に基づく機械学習によるヒトiPS細胞の神経分化指向性の解明
基于表观基因组信息的机器学习阐明人类iPS细胞的神经分化倾向
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    関谷 麻杜;髙澤 建;新井 良和;阿久津 英憲;梅澤 明弘;西野 光一郎
  • 通讯作者:
    西野 光一郎
ヒトiPS細胞におけるBCOR遺伝子のDNAメチル化による発現制御機構の解析
人iPS细胞中BCOR基因DNA甲基化表达调控机制分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    吉田里美;関谷麻杜;新井良和;西野光一郎
  • 通讯作者:
    西野光一郎
ヒト多能性幹細胞における未分化状態維持機構の解明
阐明人多能干细胞维持未分化状态的机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高橋真央;関谷麻杜;新井良和;西野光一郎
  • 通讯作者:
    西野光一郎
高次脳機能・脳構造の構築に関わるゲノム刷り込み遺伝子の探索
寻找参与构建高级大脑功能和大脑结构的基因组印记基因
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    堀家 慎一, 岡田 源作;島津 美幸,  目黒 牧子
  • 通讯作者:
    島津 美幸,  目黒 牧子
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西野 光一郎其他文献

細胞のリプログラミングを用いたMMP遺伝子ファミリーの遺伝子発現制御の解析
利用细胞重编程分析MMP基因家族的基因表达调控
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    片桐 沙紀;由良 敬;堀家 慎一;西野 光一郎;岡村 浩司
  • 通讯作者:
    岡村 浩司
深層学習を利用したトランススプライシングに関わるゲノム領域の探索
使用深度学习搜索参与反式拼接的基因组区域
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    片桐 沙弥;片桐 沙紀;西野 光一郎;岡村 浩司
  • 通讯作者:
    岡村 浩司
深層学習および線形分類を利用したトランススプライシングに関わる塩基配列の探索
使用深度学习和线性分类搜索参与反式拼接的碱基序列
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    片桐 沙弥;片桐 沙紀;青砥 早希;西野 光一郎;岡村 浩司
  • 通讯作者:
    岡村 浩司
細胞をリプログラミングすることで明らかにできたMMPファミリーの遺伝子発現機構
细胞重编程揭示MMP家族基因表达机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    片桐 沙紀;高澤 建;由良 敬;堀家 慎一;西野 光一郎;岡村 浩司
  • 通讯作者:
    岡村 浩司

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    $ 11.23万
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