Development of cell-cycle-regulated CRISPR/Cas system
Development of cell-cycle-regulated CRISPR/Cas system
批准号:
21H02469
负责人:
近藤 一成
金额:
$11.15万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
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本研究課題では、医療分野や農業分野での安全な利用を目指して,細胞周期に応じて適切なゲノム編集活性を示す「細胞周期制御型CRISPR/Casシステム」を構築するために必要な基盤研究を行うものである.修復エラーが多い非相同末端結合修復を阻害し、細胞周期のS~G2/M期への同調が編集効率と精度向上に有効であると考えられているが ,細胞周期の変化が生物自身のゲノムや細胞機能に与える影響はこれまで全く検討されていない。ヒト細胞(RPE-1)を用いて、CRISPR/CasによりDNA2本鎖誘導の過程で起きる現象について、各細胞周期で誘導するすべての変異と遺伝子発現変化を解析することで,各細胞周期で最適な条件でゲノム編集を実行できるシステムの確立を行う.すなわち、細胞自身のDNA修復機能に手を加えず,最適な細胞周期条件でゲノム編集が実行されるシステム構築を行うものである.1年目は、DNA2本鎖切断後の欠失が生じた細胞を蛍光検出できる、レポーター細胞構築のためのベクターコンストラクトを、蛍光タンパク発現をTet-on制御下で出来るようにした上で、ヒトゲノムの異なる標的部位に挿入できるように設計した。ヒト2倍体ゲノムのそれぞれのアレルをEmerald, または、Scarletで検出するためのドナーベクター作製を行った。2年目は、RPE-1細胞へ設計したドナーベクターを遺伝子導入してクローン化により樹立を行った。TK1 locusおよびAAVSへの導入を行ったところ、TK1 locusにemeraldを持つコンストラクト1コピー導入された細胞を樹立することが出来た。樹立した細胞について、導入配列を確認後、tet-onの作動性、細胞機能の野生型との違いのないことを確認して、現在、CRISPR/Cas9でDNA2本鎖した細胞をFACS解析出来るようにアッセイ系を構築している。
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DOI:
10.1101/2021.05.28.446070
发表时间:
2021-05
期刊:
bioRxiv
影响因子:
--
作者:
[Jumpei Narushima;Shinya Kimata;Yuh Shiwa;T. Gondo;Satoru Akimoto;K. Soga;Satoko Yoshiba;Kosuke Nakamura;N. Shibata;K. Kondo]
通讯作者:
Jumpei Narushima;Shinya Kimata;Yuh Shiwa;T. Gondo;Satoru Akimoto;K. Soga;Satoko Yoshiba;Kosuke Nakamura;N. Shibata;K. Kondo
国立医薬品食品衛生研究所 生化学部 ホームページ
国立健康科学研究所生物化学系主页
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
ヒト細胞TK6を用いたCRISPR/Casによる構造変異(SV)解析の検討
使用人类细胞 TK6 通过 CRISPR/Cas 进行结构变异 (SV) 分析的研究
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[近藤一成, 成島純平, 曽我慶介, 吉場聡子, 柴田識人, 坂田こずえ, 田口千恵, 加藤怜子]
通讯作者:
加藤怜子
G2/M arrest and CDK1 inhibitor treatment significantly suppress genome-wide mutations and genomic rearrangements in genome-edited cells
G2/M 期停滞和 CDK1 抑制剂治疗可显着抑制基因组编辑细胞中的全基因组突变和基因组重排
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kazunari Kondo*, Nozomi Fukuda, Keisuke Soga, Yoshiba Satoko, Jumpei Narushima, Norihito Shibata, Chie Taguchi, Kozue Sakata, Reiko Kato]
通讯作者:
Reiko Kato
自然言語処理技術を用いた食物アレルゲン性予測システム構築
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批准号:24K01707
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$8.9万
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财政年份:2024
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负责人:近藤 一成
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依托单位:
国際学会「中国史学の現状と展望」に関する企画調査
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批准号:10891007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1998
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负责人:近藤 一成
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依托单位:
宋代士大夫の精神世界と地域社会
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批准号:03610193
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1991
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负责人:近藤 一成
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依托单位:
宋代文化社会史の基礎的研究
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批准号:58510160
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1983
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负责人:近藤 一成
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依托单位:
海外基金