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“光によらない”葉緑体の炭酸同化能力と進化的原動力を紐解く

“光によらない”葉緑体の炭酸同化能力と進化的原動力を紐解く
揭开叶绿体“不依赖光”的二氧化碳同化能力及其进化驱动力
批准号:
21H02554
负责人:
谷藤 吾朗
金额:
$10.98万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2021-04-01 至 2026-03-31

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非光合成にも関わらず炭酸同化を行い無機培地で増殖する真核生物を見出したことから、その背後にある分子機構を解明する。安定同位体を用いたトレーサー実験により1)詳細な培養実験と透過型電子顕微鏡、超高解像度二次イオン質量分析機による炭酸同化物の細胞内局在・動態解析、2)同位体メタロボーム解析を行い、炭酸同化物の位置情報と代謝物の情報を組み合わせ、炭酸同化の代謝経路を明らかにする。加えて、3)全遺伝子発現解析、近縁種との比較ゲノム解析により、上記代謝経路の遺伝的背景を補強し、未知の有機物合成経路を生み出した進化多様性原動力の推定を行う。前年度までに,ゲノム・全遺伝子配列の取得と詳細な培養実験,細胞バルクでの13Cトレーサー検出を行い、また超高解像度二次イオン質量分析(nanoSIMS)、同位体メタロボーム解析の方法論を確立した。R4年度はnanoSIMS解析で,単一細胞内での13Cの局在性を確認した。同位体メタロボーム解析では,当初予定していたキャピラリ電気泳動(CE)+質量選択検出(MS)に加え、化合物検出における網羅性は低いがより感度の高い液体クロマトグラフィー(LC)+ 質量選択検出(MS)での解析を加え、炭酸同化反応における中間生成物から13Cトレーサーを検出した。また、それら中間生成物を触媒する酵素タンパク質群を全遺伝子発現解析データから精査し、それらの細胞内での局在を予測した。
期刊论文(20)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
盗葉緑体生物のNitrate reductase様遺伝子の機能
盗窃叶绿体生物中硝酸还原酶样基因的功能
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Cao Rui, Li Jun, Koyabu Daisuke, 丸山萌・加賀本剛・谷藤吾朗・中澤昌美・柏山祐一郎]
通讯作者: 丸山萌・加賀本剛・谷藤吾朗・中澤昌美・柏山祐一郎
様々なヘテロ接合度の生物を用いたゲノムアセンブリ手法の評価
使用各种杂合性生物体评估基因组组装方法
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [井上綾, 井上貴斗, 森哲, 森直樹, 望月孝子・坂本美佳・谷澤靖洋・中山卓郎・谷藤吾朗・神川龍馬・中村保一]
通讯作者: 望月孝子・坂本美佳・谷澤靖洋・中山卓郎・谷藤吾朗・神川龍馬・中村保一
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [望月 孝子, 坂本 美佳, 谷澤 靖洋, 中山 卓郎, 谷藤 吾朗, 神川 龍馬, 中村 保一]
通讯作者: 中村 保一
Biosynthesis of chlorophyll-related pigments in non-photosynthetic algae
非光合藻类中叶绿素相关色素的生物合成
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Christa E Moore, Tyler Mills, Naoko T Onodera, Yuichiro Kashiyama, John M Archibald, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto, 厳翼; 久米慶太郎; 阿部一貴; 矢﨑裕規; 小松崎洋志; 谷藤吾朗; 神川龍馬; 稲垣 祐司; 橋本哲男, Ryoma Kamikawa]
通讯作者: Ryoma Kamikawa
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    “光によらない”葉緑体の炭酸同化能力と進化的原動力を紐解く
    脳血管路形成に関する極性と方向の制御機構の解明
    • 批准号:
      19790155
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.32万
    • 财政年份:
      2007
    • 负责人:
      谷藤 吾朗
    • 依托单位:
    海外基金