Long read sequencing to expand the accessible genetic architecture of autism

长读长测序扩大自闭症的可访问遗传结构

• 批准号: 21H02848
• 负责人: 木村 大樹
• 金额: $ 11.32万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02848/
• 关键词: 自閉スペクトラム症; 全ゲノムシークエンス; ロングリードシークエンス; リピート配列; 構造多型; 多発家系

近年１分子シークエンス技術の進化と共に１万塩基以上に及ぶロングリードを用いたシークエンスが可能となり、ショートリードのWGSでは同定困難な小規模なゲノムコピー数多型（CNV）や、全ゲノム配列の約半分に及ぶリピート配列の変異が同定可能である。以上を踏まえ本研究では、自閉スペクトラム症（ASD）脆弱性変異を効率良く同定可能と考えられるASD多発家系の中から、①従来のショートリードのWGSでは脆弱性変異が同定されないASD多発10家系（50検体）を抽出、②家系全体を対象にロングリードによるWGS、③変異のサイズ、頻度、遺伝子発現への影響に基づくフィルタリング、④発症脆弱変異の家系内での意義付け評価、⑤発症脆弱性を有する小規模CNVやリピート配列によるASD発症メカニズムの検証、を実施する予定である。令和４年度は、１）ASDとASDと共通の遺伝基盤を有する統合失調症の多発家系のエクソーム解析データと全ゲノムCNV解析データから、発症脆弱性につながるゲノムバリアントを有する家系を除外した上でロングリードシークエンスを実施する家系の選定を行い、その成果を論文化した。さらに、２）ASD発症に強い影響を持ちうるゲノムバリアントを持つ患者群の臨床経過の特徴をまとめ、論文化した。３）１）２）の結果に基づき、ロングリードの多発家系解析にてASD発症脆弱性変異が同定される期待値の高い家系を抽出し、ロングリードシークエンスを実施し、小規模なゲノムコピー数多型（CNV）や、全ゲノム配列の約半分に及ぶリピート配列の変異を抽出するパイプラインを作成を行なった。

In recent years, the evolution of 1-molecule biosynthetic technology has led to the development of 10,000-kilometre-percent ion-based polymers and biomolecules.グリードを用いたシークエンスがpossibleとなり、ショートリードのW It is difficult to determine the same for GS, but it is possible to determine the same number of small-scale CNV (CNV), full CNV, and CNV. The above results show that this study shows that autism spectrum disorder (ASD) has different vulnerabilities and has good efficiency, so it is possible to find out whether there are many families with ASD. , ① 従来のショートリードのWGS では Vulnerability Changing Different が同定されないASD Multi-発 10 families (50 bodies) を Extraction , ② All families を対 resemble にロングリードによるWGS, ③変differentのサイズ, frequency, remaining 伝子発 appearへの Impact に base づ く フ ィ ル タ リ ン グ, ④ 発 syndrome vulnerability and difference の within the family で のSignificance of evaluation, ⑤ disease vulnerability を There is a small-scale CNV やピート arrangement, ASD disease メカニズムの検 syndrome, を実する predetermined である. Reiwa 4th year, 1) ASD, ASD, and common integrative disorder CNV analysis of many families Symptoms of Vulnerabilityリードシークエンスを実士する的family の Selected を行い、そのachievement を文文した.さらに, 2) ASD disease has a strong impact on the clinical characteristics of the patient group, and the theory of culture. ３）1）２）The result of the analysis of the family of ASD and ASD Fragility is different and the same is determined. Expectation is high and the family is drawn out.ンスを実士し, small-scale なゲノムコピーnumerical type (CNV), full ゲノムarray About half of the に and ぶリピート arrangement of the の変different を extracted するパイプラインを to make を行なった.

项目成果

Electroconvulsive therapy as a potential therapeutic option in psychiatric‐onset prodromal dementia with Lewy bodies

电惊厥疗法作为路易体精神病性前驱痴呆的潜在治疗选择

• DOI: 10.1002/gps.5863
• 发表时间: 2022
• 期刊: International Journal of Geriatric Psychiatry
• 影响因子: 4
• 作者: Kimura Hiroki;Yokoyama Haruka;Torii Youta;Fujishiro Hiroshige
• 通讯作者: Fujishiro Hiroshige

精神医学領域の論文を読みこなすキーワード100! 全エクソームシ ークエンス/全ゲノムシークエンス

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• 发表时间: 2023
• 作者: 塚本 康寛;川村 敦生;魏 威凛;Ayhan Yurtsever;白石 大智;中山 敬一;古寺 哲幸;福間 剛士;西山 正章;木村大樹
• 通讯作者: 木村大樹

自閉スペクトラム症患者を対象とした全ゲノム解析により、神経細胞シナプス機能の病態への関与を証明

自闭症谱系障碍患者的全基因组分析证明神经元突触功能参与病理学

カリフォルニア大学サンディエゴ校精神科(米国)

加州大学圣地亚哥分校精神病学系（美国）