Genomic profiling and drug screening among organoids derived from ovarian cancer patients

【目的】2021年度は（１）婦人科がんにおいて、オルガノイド培養株を樹立し、ゲノムプロファイリングや薬剤感受性試験を行う、（２）本学独自のがん遺伝子パネル検査Todai OncoPanelの性能評価、（３）TOPの婦人科がんにおける有用性の検証を行うことを研究目的とした。【方法】（１）婦人科がんの手術摘出検体においてオルガノイド培養系を行い、長期培養が可能であった子宮頚部小細胞癌において、全エクソンシークエンス解析、RNA-Sequenceを行った。（２）卵巣がんなどの各種固形がん23例について、DNAとRNAのTwin panelであるTodai OncoPanel(TOP)の解析結果（従来版TOP1と改良版TOP2）、全エクソンシークエンス結果と比較し、遺伝子変異頻度（TMB: Tumor Mutational Burden）の評価精度を検証した。（３）TOP1先進医療B実施200例について、婦人科がん症例の変異プロファイルを検討した。【成績】（１）子宮頸癌、子宮体癌、卵巣癌の各検体においてオルガノイドの短期的な培養系を確立した。このうち子宮頚部小細胞癌症例において、オルガノイドを用いたゲノム解析が可能であり、薬剤感受性の準備を進めた。（２）TMBの評価において、TOP2において全エクソンシークエンス結果とより相関が高い結果が得られ、論文投稿準備に進んだ。（３）TOP1先進医療B実施61例につき、卵巣癌、子宮体癌、子宮頸癌のそれぞれについて組織型とGenotypeの関連性をまとめ、学会で報告を行った。【結論】オルガノイド培養系を樹立し、マルチオミクス解析データと薬剤感受性の統合に向けた準備を進めた。TOP2における性能の向上を確認するとともに、婦人科がんにおけるTOPの有用性を明らかとした。

【目的】2021年度は（１）婦人科がんにおいて、オルガノイド培養株を樹立し、ゲノムプロファイリングや薬剤感受性試験を行う、（２）本学独自のがん遺伝子パネル検査Todai OncoPanelの性能評価、（３）TOPの婦人科がんにおける有用性の検証を行うことを研究目的とした。【方法】（１）婦人科がんの手術摘出検体においてオルガノイド培養系を行い、長期培養が可能であった子宮頚部小細胞癌において、全エクソンシークエンス解析、RNA-Sequenceを行った。（２）卵巣がんなどの各種固形がん23例について、DNAとRNAのTwin panelであるTodai OncoPanel(TOP)の解析結果（従来版TOP1と改良版TOP2）、全エクソンシークエンス結果と比較し、遺伝子変異頻度（TMB: Tumor Mutational Burden）の評価精度を検証した。（３）TOP1先進医療B実施200例について、婦人科がん症例の変異プロファイルを検討した。【成績】（１）子宮頸癌、子宮体癌、卵巣癌の各検体においてオルガノイドの短期的な培養系を確立した。このうち子宮頚部小細胞癌症例において、オルガノイドを用いたゲノム解析が可能であり、薬剤感受性の準備を進めた。（２）TMBの評価において、TOP2において全エクソンシークエンス結果とより相関が高い結果が得られ、論文投稿準備に進んだ。（３）TOP1先進医療B実施61例につき、卵巣癌、子宮体癌、子宮頸癌のそれぞれについて組織型とGenotypeの関連性をまとめ、学会で報告を行った。【結論】オルガノイド培養系を樹立し、マルチオミクス解析データと薬剤感受性の統合に向けた準備を進めた。TOP2における性能の向上を確認するとともに、婦人科がんにおけるTOPの有用性を明らかとした。