Comprehensive genetic and morphological analysis for sudden cardiac death autopsy cases

心源性猝死尸检病例的综合遗传和形态学分析

• 批准号: 21H03211
• 负责人: 畑 由紀子
• 金额: $ 11.23万
• 依托单位: University of Toyama
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03211/
• 关键词: Molecular Autopsy; 突然死; エクソーム解析; Sudden death; Exome analysis; 法医学; 病理組織学的検索; 遺伝子変異; exome analysis

本年度は、21症例の突然死症例について全エクソーム解析を行なった。全症例について、以下に示す通り病理組織学的検索および遺伝子解析を行なった。1. 突然死症例の病理組織学的検索は、微細な病理学的変化を明らかにすることを目的に、死因、肉眼所見を問わず刺激伝導系の切り出しを含め常に15ヶ所以上の心臓組織標本を作製し観察を行った。加えて、その他主要臓器については2ヶ所以上、脳については20ヶ所以上標本を作製して観察を行った。2. 突然死症例の遺伝子解析は、剖検時採取した血液からDNAを抽出し、エクソーム解析を施行した。また、説明・同意をえられた家族については、スワブで採取した口腔粘膜細胞からDNA抽出し、エクソーム解析を施行した。突然死剖検例に対する遺伝子検索手法の確立を目指すために、検出されたバリアントについて、1) 日本人の稀少変異(頻度1%以下)の抽出、2) 疾患データベースのClinVar、HGMDを用いた検索、3) 米国臨床遺伝・ゲノム学会のガイドラインに従った評価、4) 機能予測ツールを用いて病原性を評価した。検出したバリアントについては、Human Phenotype Ontology (HPO)やOnline Mendelian Inheritance in Man (OMIM)などを用いて疾患関連遺伝子で分類した。また、病歴や健康診断の心電図などできる限り入手した。そのうち40代男性症例について、生前の心電図、刺激伝導系の病理組織学的検索、遺伝子解析の結果についてまとめ学会発表・論文作成を行なった。また、これまでの当教室で実施したてんかん症例の遺伝子検索についての講演を行った。本年度の補助金は、研究を遂行するための遺伝子解析、遺伝子解析ソフト及びバリアントの機能解析に用いるキット購入の費用にあてられた。

This year, 21 cases of sudden death were analyzed. All cases are described below as pathologically relevant and genetic analysis. 1. Pathological findings of sudden death, microscopic changes in pathology, objective, cause of death, visual findings, stimulation, and conduction systems are often included in the study of cardiac tissue. Add 2. Sudden death case DNA analysis is performed at the time of diagnosis. Please note that the DNA extraction and analysis of oral mucosa cells were performed. Sudden death cases include: 1) extraction of rare disease (frequency less than 1%) in Japanese; 2) detection of disease in Clinvar and HGMD; 3) evaluation of pathogenicity in American clinical heritages; 4) evaluation of pathogenicity in functional prediction. Human Phenotype Ontology (HPO) and Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) are used to classify disease-related genes. The diagnosis of heart disease and heart failure should be started. 40 generations of male cases, ECG before death, stimulation of the pathological organization of the search, genetic analysis of the results of the study, paper preparation This is the first time that we've had a chance to talk about this topic. This year's grant includes the cost of gene analysis, gene analysis software and gene function analysis.

项目成果

Pathological and Comprehensive Genetic Investigation for Autopsy Cases with Advanced Bradyarrhythmia.

晚期缓慢性心律失常尸检病例的病理学和综合基因研究。

• 发表时间: 2021
• 作者: Tsuchiya H;Tomida S;Abe M;Higashimura S;Minematsu T;Sanada H. Nakagami G.;畑由紀子，一萬田正二郎，西田尚樹.
• 通讯作者: 畑由紀子，一萬田正二郎，西田尚樹.

Clinicopathologic Appearance of Advanced Ketoacidosis With Basal Vacuolation in Renal Tubules

伴有肾小管基底空泡的晚期酮症酸中毒的临床病理表现

• DOI: 10.5858/arpa.2021-0226-oa
• 发表时间: 2022
• 期刊: Archives of Pathology & Laboratory Medicine
• 作者: Ichimata Shojiro;Hata Yukiko;Nishida Naoki
• 通讯作者: Nishida Naoki

てんかんの病理と遺伝子検索

癫痫病理学和基因搜索

• 发表时间: 2022
• 作者: 西田尚樹;畑由紀子
• 通讯作者: 畑由紀子

Barlow症候群による心臓突然死の一剖検例

巴洛综合征心源性猝死尸检一例

• 发表时间: 2022
• 作者: Shinkawa N;Kakizaki E;Sonoda A;Yukawa N;畑由紀子，一萬田正二郎，西田尚樹
• 通讯作者: 畑由紀子，一萬田正二郎，西田尚樹

Emery-Dreifuss型筋ジストロフィーⅤによる心臓突然死と考えられた一剖検例．

尸检发现的心源性猝死病例被认为是由于埃默里-德莱福斯肌营养不良症 V 所致。

• 发表时间: 2021
• 作者: Miyake Yoshihiro;Tanaka Keiko;Okubo Hitomi;Sasaki Satoshi;Tokinobu Akiko;Arakawa Masashi;八若遼太朗，畑由紀子，一萬田正二郎，西田尚樹．
• 通讯作者: 八若遼太朗，畑由紀子，一萬田正二郎，西田尚樹．