酸性極限環境におけるバイオフィルム樹状構造化の謎とその金属元素循環への影響の解明

阐明极端酸性环境下生物膜树突结构之谜及其对金属元素循环的影响

• 批准号: 21H03595
• 负责人: 稲葉 知大
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03595/
• 关键词: バイオフィルム; 休廃止鉱山; 微生物生態学

本研究課題では多種の微生物が群集構造体（バイオフィルム）を形成する分子機構を明らかにし、形成されたバイオフィルムの立体構造が周辺環境に与える機能を解析することで、元素循環を介した地球環境と微生物群集生態の相互作用を明らかにすることを最終的な目的としている。研究対象として、休廃止鉱山内に見られる、高度に発達した樹上構造を持つバイオフィルムを選定し、本年は硫黄や黄鉄鉱を産出した鉱山におけるバイオフィルムサンプルの詳細な解析を実施した。複雑な樹状に発達したバイオフィルムを目視により判別可能なマクロ構造ごとに分類し、メタトランスクリプトームおよびメタゲノム解析に供することで分子生物学的なプロファイルを取得した。さらにバイオフィルム立体構造について、詳細な光学的解析の実施を予定している。また分子生物学的な解析をさらに発展させマイクロバイオーム、トランスクリプトーム解析結果を立体構造情報と統合することを次年度以降目指す。

This research topic で は various microbial が の cluster constructs (バ イ オ フ ィ ル ム) を form す る molecular institutions を Ming ら か に し, forming さ れ た バ イ オ フ ィ ル ム の three-dimensional structure が weeks 辺 environment に and え る function analytical す を る こ と で, element cycle を interface し た earth environment と microbial interaction between cluster ecological の を Ming ら か に す る こ と を な eventually Objective: と て て る る. Study like と seaborne し て, Hugh 廃 check 鉱 yamauchi に see ら れ る, highly に 発 da し た tree structure を hold つ バ イ オ フ ィ ル ム を し selected objects, this year や は sulfur yellow iron 鉱 を output し た 鉱 mountain に お け る バ イ オ フ ィ ル ム サ ン プ ル の detailed analytical を な be applied し た. Complex 雑 な tree に 発 da し た バ イ オ フ ィ ル ム を visual に よ り discriminant may な マ ク ロ tectonic ご と に classification し, メ タ ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム お よ び メ タ ゲ ノ ム parsing に for す る こ と で molecular biology な プ ロ フ ァ イ ル を obtain し た. さ ら に バ イ オ フ ィ ル ム three-dimensional structure に つ い て, detailed な optical analytical の be applied を designated し て い る. ま た molecular biology な parsing を さ ら に 発 exhibition さ せ マ イ ク ロ バ イ オ ー ム, ト ラ ン ス ク リ プ ト ー ム analytical results を three-dimensional structure intelligence と integration す る こ と を annual in refers す.