次世代の耐性菌対策を考慮した、国際的ハイリスク病原性細菌の市中内定着様式の解明

阐明国际高危病原菌在社区中的定植模式，考虑针对耐药菌的下一代措施

• 批准号: 21H03622
• 负责人: 佐藤 豊孝
• 金额: $ 10.98万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03622/
• 关键词: 細菌学; 薬剤耐性; フルオロキノロン耐性; 大腸菌; 細菌; 薬剤耐性菌; ST131; 分子疫学

本研究では、フルオロキノロン耐性大腸菌ST131をモデルに、『院内』で問題となるAMR感染症を『院外(市中)』からのプローチでその伝播・定着様式を明らかにすることで、現行のAMR対策が報われない国際的なAMR問題の根本的解決に繋がる次世代型(院内-市中一体型)AMR対策に資する科学的知見を提供することが本研究の目的である。本目的達成の為、本年度は昨年度に引き続き、ST131の伝播状況と伝播様式および定着メカニズム(定着因子の同定)を行なった。各サンプル群(人、犬・猫、家畜、河川・下水)からのST131の収集を拡大した。これらの菌株からDNAを抽出し、抽出したDNAを用いてDNAライブラリーを作製した。作製したDNAライブラリーを次世代シークエンサーで解析し、各菌株のゲノム情報を得た。得られたゲノム配列を用いてアクセサリーゲノム解析を行なった。その結果、人-犬・猫-下水との間で互いに遺伝的相同性が高いST131を認めた。また、得られたST131の糞便環境中での生存に重要となる細菌因子をTransposon-directed sequencing(TraDIS)法にて網羅的に抽出した。本年度は糞便抽出液を作製し、本抽出液存在下での生存に重要なST131遺伝子の抽出をTraDIS法を用いて行なった。TraDIS結果、７遺伝子の抽出に成功した。本候補遺伝子の遺伝子特異的欠損株を作製し評価したところ、3遺伝子において当該遺伝子欠損株の糞便抽出液存在下での増殖は弱く(または増殖しなく)なった。以上からこれら3遺伝子は糞便内でのST131の生存に重要な細菌因子であることが確認できた。

This study is based on the research on resistant coliform bacteria ST131 and "in-hospital" problems. AMR infectious diseaseを『Outside the hospital (in the city)』からのプローチでその伝 Broadcast・SET様styleを明らかにすることで、The current AMR policy is a fundamental solution to the international AMR problem and the next generation model ( The purpose of this study was determined by the scientific knowledge provided by the AMR policy in the hospital and the municipality. The purpose of achieving this goal, the current year's performance of last year's work, ST131's broadcast situation and broadcast situation, the broadcast status of the project, and the performance of the project. Each animal group (human, dog, cat, domestic animal, river, water) is collected by ST131.これらの strain からDNA をextraction し, extracted したDNAを いてDNAライブラリーを した. Analysis of the next-generation DNA reagent produced and the information on each strain was obtained. Get the られたゲノムmatching を and use the いてアクセサリーゲノムanalysis を行なった.そのRESULTS, the similarity between humans, dogs, and cats, and between the water and the water, is high and ST131 is recognized. ST131 is a bacterial factor that is important for survival in the fecal environment and is extracted using the Transposon-directed sequencing (TraDIS) method. This year's feces aspirate is produced, and it is important to survive in the presence of this aspirate. ST131 is extracted using the TraDIS method and is used. TraDIS results, the extraction of the 7 remaining pieces was successful. This candidate's Supplementary 伝子の缝子specific defective strain を燗羡したところ, 3缝子において道In the presence of the fecal extract of the damaged strain, the growth rate of the plant is weak. The above confirmed bacterial factors that are important for the survival of ST131 in feces were confirmed.

项目成果

Corrigendum to 'Clonal/subclonal changes and accumulation of CTX-M-type β-lactamase genes in fluoroquinolone-resistant Escherichia coli ST131 and ST1193 strains isolated during the past 12 years, Japan

过去 12 年日本分离的耐氟喹诺酮类大肠杆菌 ST131 和 ST1193 菌株中 CTX-M 型 β-内酰胺酶基因的克隆/亚克隆变化和积累的更正

• DOI: 10.1016/j.jgar.2022.12.008
• 发表时间: 2023
• 期刊: J Glob Antimicrob Resist
• 作者: Fukushima Y;Sato T; Tsukamoto N;Nakajima C;Suzuki Y;Takahashi S;Yokota SI
• 通讯作者: Yokota SI

薬剤耐性菌の克服に向けた感染部位特異的治療薬の開発

开发感染部位特异性治疗剂以克服耐药细菌

• 发表时间: 2022
• 作者: Leakhena Hang;Srean Aun;Muhammad Amin;Worradorn Phairuang;Chanmoly Or;Takahiro Tabuchi;Mitsuhiko Hata and Masami Furuuchi;佐藤 豊孝
• 通讯作者: 佐藤 豊孝

One Health Approachに基づいた フルオロキノロン耐性大腸菌の市中内拡散・定着様式の解明

基于One Health Approach阐明氟喹诺酮类耐药大肠杆菌的社区传播和定植模式

• 发表时间: 2022
• 作者: 佐藤 豊孝;立花 徹;玉井 聡;星野 祐治;鳥越 慎吾; 榊原 啓一郎;福田 昭;大久保 寅彦;臼井 優;塚本;髙橋 聡;横田 伸一;田村 豊;堀内 基広
• 通讯作者: 堀内 基広

Next-generation sequencing of 16S rRNA for identification of invasive bacterial pathogens in a formalin-fixed paraffin-embedded placental specimen: a case report of perinatal fulminant Streptococcus pyogenes infection

• DOI: 10.1007/s00795-021-00298-2
• 发表时间: 2021-07-21
• 期刊: MEDICAL MOLECULAR MORPHOLOGY
• 影响因子: 1.8
• 作者: Mariya, Tasuku;Sato, Toyotaka;Saito, Tsuyoshi
• 通讯作者: Saito, Tsuyoshi

多剤耐性菌の克服に向けた新たなアプローチ 感染部位特異的細菌感染症治療法の開発

克服多重耐药细菌的新方法：开发针对细菌感染的感染部位特异性治疗方法

• 发表时间: 2022
• 作者: 林稜也;安池一貴;片桐美紀;大前貴裕;窪野一郎;田代陽介;二又裕之;望月友貴;佐藤 豊孝
• 通讯作者: 佐藤 豊孝